94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  100 
 
 		 534 aa  1074    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  59.32 
 
 		 533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  53.35 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  57.4 
 
 		 543 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  48.61 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  44.18 
 
 		 534 aa  425  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  37.15 
 
 		 544 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  36.83 
 
 		 543 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  34.89 
 
 		 541 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  31.66 
 
 		 502 aa  237  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  33.33 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  37.3 
 
 		 538 aa  225  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  37.67 
 
 		 543 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  34.8 
 
 		 513 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  28.82 
 
 		 533 aa  133  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 547 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.16 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.37 
 
 		 543 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1150 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 591 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 591 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.17 
 
 		 623 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 591 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 556 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.99 
 
 		 1132 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  24.73 
 
 		 554 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 		 1150 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.34 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 657 aa  73.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.15 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  22.17 
 
 		 738 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  27.22 
 
 		 889 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.9 
 
 		 1152 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.27 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  27.05 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  27.05 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  27.05 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.85 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  26.83 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  27.05 
 
 		 632 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  27.05 
 
 		 632 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  27.05 
 
 		 632 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 		 1146 aa  67  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 567 aa  67  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.7 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  27.46 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1152 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.91 
 
 		 696 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.06 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 578 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.46 
 
 		 583 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 564 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  28.05 
 
 		 622 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 		 593 aa  56.2  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 582 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 546 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 563 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  49.23 
 
 		 563 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.6 
 
 		 526 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07267  conserved hypothetical protein  32 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.534506 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 581 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  24.55 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.39 
 
 		 570 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 577 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 		 535 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.77 
 
 		 537 aa  50.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  34.74 
 
 		 551 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.79 
 
 		 550 aa  50.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  38.36 
 
 		 521 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.63 
 
 		 520 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.76 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  35.05 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 		 587 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.75 
 
 		 552 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.44 
 
 		 527 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.93 
 
 		 525 aa  47.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  28.93 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.46 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.44 
 
 		 518 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.08 
 
 		 579 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  29.91 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.15 
 
 		 565 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  34.38 
 
 		 530 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.1 
 
 		 532 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.14 
 
 		 532 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.1 
 
 		 532 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07230  cellobiose dehydrogenase (AFU_orthologue; AFUA_2G17620)  48.89 
 
 		 780 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267409  normal  0.372324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.97 
 
 		 532 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>