More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2439 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 290 aa  585  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0620  Polyprenyl synthetase  44.79 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  45.83 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  46.5 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  46.71 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  46.02 
 
 		 300 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  45.8 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  44.19 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  43.13 
 
 		 293 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 		 293 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  42.27 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  40.07 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  45.55 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  39.52 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  40.89 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  41 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 294 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  45.17 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  44.83 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  45.09 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  42.47 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  47.74 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  47.74 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  42.91 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  42.03 
 
 		 296 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  41.38 
 
 		 294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  47.04 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  47.04 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  47.04 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  47.04 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  47.04 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  41.38 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  44.11 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  42.66 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  44.57 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  47.04 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.78 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  40.96 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  45.39 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  46.69 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  42.21 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  44.12 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.24 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  42.03 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  41.26 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  47.73 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  47.73 
 
 		 293 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  43.61 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  44.25 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  45.79 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  44.57 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  44.57 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  44.57 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  44.57 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  44.57 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  43.69 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  44.57 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  44.57 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  44.57 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  40.56 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  40.75 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  38.91 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  44.88 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  43.49 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  44.14 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  44.15 
 
 		 299 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  44.15 
 
 		 299 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  44.15 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  44.15 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  44.15 
 
 		 299 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  38.95 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  39.86 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  41.11 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  38.95 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  38.43 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  38.43 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  41.52 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.15 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  43.84 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  39.18 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  39.18 
 
 		 293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>