100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1707 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  100 
 
 
178 aa  366  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  66.67 
 
 
181 aa  246  2e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  42.22 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.48 
 
 
364 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.53 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  37.78 
 
 
379 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 
387 aa  70.9  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  32.12 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  32.12 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  31.58 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  31.39 
 
 
361 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  31.39 
 
 
361 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  31.39 
 
 
361 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  31.39 
 
 
255 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  37.65 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  37.65 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 
377 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  28.26 
 
 
342 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1204  hypothetical protein  30.07 
 
 
310 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.919148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  28.26 
 
 
342 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  33.72 
 
 
349 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  36.47 
 
 
370 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  26.15 
 
 
348 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
345 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
345 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
345 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
345 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
345 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  32.35 
 
 
353 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  33.64 
 
 
353 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  27.66 
 
 
366 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  27.59 
 
 
362 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  26.15 
 
 
348 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0677  hypothetical protein  24.32 
 
 
314 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  24.26 
 
 
364 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  25.36 
 
 
370 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10191  predicted protein  23.49 
 
 
295 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.538025  normal  0.129963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 
364 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  31.25 
 
 
148 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  23.91 
 
 
348 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  27.27 
 
 
353 aa  54.3  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  29.91 
 
 
367 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  23.57 
 
 
347 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  23.57 
 
 
347 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  31.71 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2315  hypothetical protein  24.39 
 
 
356 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  24.44 
 
 
343 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  24.46 
 
 
347 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  25.19 
 
 
351 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  32.08 
 
 
345 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  23.91 
 
 
345 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  24.06 
 
 
349 aa  52  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  27.07 
 
 
330 aa  51.2  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2347  hypothetical protein  28.26 
 
 
358 aa  51.2  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  27.82 
 
 
331 aa  51.2  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  22.86 
 
 
347 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  25.19 
 
 
351 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  30.17 
 
 
377 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  24.55 
 
 
365 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
351 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  23.42 
 
 
348 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
126 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  21.28 
 
 
348 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  30.34 
 
 
283 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  27.83 
 
 
372 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  23.7 
 
 
334 aa  48.5  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  43.28 
 
 
123 aa  47.8  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2077  hypothetical protein  23.97 
 
 
309 aa  47.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.520614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
255 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  21.68 
 
 
357 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 
129 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  32.76 
 
 
155 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  25 
 
 
368 aa  44.7  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  27.08 
 
 
344 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 
662 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  31.17 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  37.33 
 
 
132 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  28.74 
 
 
348 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  28.74 
 
 
348 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 
115 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.09 
 
 
363 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  27.17 
 
 
318 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3856  cupin 2, barrel  29.63 
 
 
123 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.875667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  23.76 
 
 
324 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 
135 aa  41.2  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  35 
 
 
129 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  29.32 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0782  cupin 2 domain-containing protein  35.19 
 
 
144 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.961846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  23.44 
 
 
130 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3622  hypothetical protein  31.94 
 
 
247 aa  40.8  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>