More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7134 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  100 
 
 
662 aa  1336    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  79.51 
 
 
536 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  77.75 
 
 
539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  75.54 
 
 
542 aa  600  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  76.76 
 
 
532 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  75.54 
 
 
540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  68.89 
 
 
540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  59.96 
 
 
792 aa  558  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  69.41 
 
 
651 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  48.47 
 
 
703 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  54.45 
 
 
521 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  39.3 
 
 
762 aa  326  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  42.07 
 
 
854 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  39.17 
 
 
652 aa  303  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  42.22 
 
 
430 aa  260  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  36.7 
 
 
559 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  38.04 
 
 
425 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  36.17 
 
 
400 aa  211  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  35.12 
 
 
1271 aa  206  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  34.9 
 
 
414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  35.7 
 
 
455 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  33.01 
 
 
439 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  35.42 
 
 
472 aa  195  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  33.17 
 
 
451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  35.68 
 
 
586 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  34.16 
 
 
763 aa  177  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  31.68 
 
 
1080 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 
674 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.89 
 
 
674 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  32.79 
 
 
674 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  33.25 
 
 
482 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 
652 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  32.56 
 
 
674 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.07 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  32.48 
 
 
674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  32.48 
 
 
674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  32.48 
 
 
674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  32.48 
 
 
674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  28.92 
 
 
848 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.72 
 
 
674 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  34.22 
 
 
398 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  31.29 
 
 
675 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  27.83 
 
 
868 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  31.09 
 
 
484 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  30.84 
 
 
868 aa  160  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 
868 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  30.41 
 
 
868 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  30.36 
 
 
869 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  30.41 
 
 
868 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  27.06 
 
 
867 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  27.23 
 
 
639 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  30.12 
 
 
868 aa  158  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.42 
 
 
848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
863 aa  152  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  32.91 
 
 
505 aa  150  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  28.23 
 
 
855 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  32.08 
 
 
997 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.06 
 
 
972 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  31.4 
 
 
396 aa  147  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  31.04 
 
 
463 aa  147  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  41.48 
 
 
2170 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  32.01 
 
 
373 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  30.05 
 
 
563 aa  143  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  29.58 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  32.23 
 
 
431 aa  128  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  28.17 
 
 
372 aa  127  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  31.29 
 
 
1362 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  30.94 
 
 
401 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.59 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.79 
 
 
499 aa  120  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 
1578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  85 
 
 
561 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.21 
 
 
657 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  28.27 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  30.08 
 
 
366 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  44.1 
 
 
1762 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  62.89 
 
 
608 aa  111  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  29.44 
 
 
1146 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 
465 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  29.41 
 
 
382 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  30.09 
 
 
772 aa  107  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  26.4 
 
 
861 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  26.43 
 
 
1132 aa  104  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  51.33 
 
 
614 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  44.06 
 
 
1154 aa  103  9e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  27.18 
 
 
563 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  27.85 
 
 
904 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  61.29 
 
 
743 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  69.62 
 
 
973 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  44.59 
 
 
1170 aa  98.6  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
364 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  28.61 
 
 
1127 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  28.61 
 
 
1127 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 
1127 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  28.32 
 
 
1127 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  27.16 
 
 
1051 aa  96.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.85 
 
 
634 aa  95.5  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  26.21 
 
 
1053 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  51.69 
 
 
455 aa  94  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>