More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5051 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 502 aa  930    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  56.77 
 
 		 526 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  56.99 
 
 		 513 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  52.8 
 
 		 524 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  56.39 
 
 		 517 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  50.72 
 
 		 518 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  52.72 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  53.27 
 
 		 536 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  53.86 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  51.83 
 
 		 528 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  54.74 
 
 		 558 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  48.98 
 
 		 562 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  55.9 
 
 		 496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  56.06 
 
 		 539 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  51.84 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 		 521 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  51.06 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  49.69 
 
 		 529 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  49.28 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  52.89 
 
 		 540 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  54.43 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  47.53 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 525 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 		 553 aa  375  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  51.68 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  50.43 
 
 		 514 aa  359  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  48.8 
 
 		 588 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 584 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 509 aa  355  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 514 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  48.45 
 
 		 521 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 541 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 477 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 533 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 532 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  47.19 
 
 		 554 aa  332  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  44.18 
 
 		 535 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.21 
 
 		 563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.53 
 
 		 537 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  47.15 
 
 		 513 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  50.89 
 
 		 528 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 555 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  45.05 
 
 		 519 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 601 aa  317  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 		 524 aa  316  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 490 aa  316  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  47.6 
 
 		 513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  46.61 
 
 		 535 aa  309  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  47.5 
 
 		 508 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  45.44 
 
 		 505 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  40.17 
 
 		 492 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 516 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 		 536 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  40.48 
 
 		 517 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  42.14 
 
 		 516 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.37 
 
 		 525 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  39.58 
 
 		 510 aa  257  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 504 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  40.79 
 
 		 517 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 		 511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 495 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.46 
 
 		 534 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 500 aa  238  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  38.9 
 
 		 528 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  40.27 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  38.55 
 
 		 500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.58 
 
 		 522 aa  229  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 514 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 524 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 594 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  37.91 
 
 		 495 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  37.91 
 
 		 495 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  37.91 
 
 		 495 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  37.91 
 
 		 495 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.38 
 
 		 532 aa  219  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.31 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 607 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.12 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 506 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  37.91 
 
 		 495 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  39.33 
 
 		 501 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.63 
 
 		 538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  37.07 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 519 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.9 
 
 		 626 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>