More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0831 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  100 
 
 		 526 aa  1010    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  55.98 
 
 		 528 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  53.27 
 
 		 518 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 		 524 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  52.99 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  55.65 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  56.31 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  55.8 
 
 		 517 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  54.71 
 
 		 558 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 		 562 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  53.55 
 
 		 536 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  53.2 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  55.25 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  54.03 
 
 		 540 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  50.1 
 
 		 509 aa  445  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  52.02 
 
 		 529 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 481 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  51.1 
 
 		 553 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  57.87 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  49.71 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  51.61 
 
 		 575 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 509 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  51.66 
 
 		 539 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  47.12 
 
 		 528 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  51.27 
 
 		 516 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 584 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  50.98 
 
 		 528 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 514 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  46.53 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  45.4 
 
 		 535 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  44.2 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  48.05 
 
 		 563 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  43.42 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 		 497 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  46.63 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  44.82 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  44.01 
 
 		 532 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  42.69 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  44.76 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.83 
 
 		 537 aa  344  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 555 aa  342  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  46.64 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  44.59 
 
 		 535 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 		 490 aa  316  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 508 aa  315  9e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  43.26 
 
 		 505 aa  312  9e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  39.96 
 
 		 516 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.18 
 
 		 492 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 511 aa  276  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 		 525 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  39.53 
 
 		 516 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 503 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  39.03 
 
 		 517 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 504 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 538 aa  253  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.97 
 
 		 534 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  37.28 
 
 		 528 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  39.92 
 
 		 506 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 495 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.76 
 
 		 532 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.16 
 
 		 513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  35.96 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.54 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  37.45 
 
 		 594 aa  226  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 494 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 503 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.11 
 
 		 503 aa  224  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 515 aa  223  7e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 523 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 507 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.3 
 
 		 626 aa  217  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 		 522 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.92 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  36.29 
 
 		 501 aa  213  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  36.13 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  36.13 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  36.13 
 
 		 495 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  36.13 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>