More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2478 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2478  agmatinase  100 
 
 		 309 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00187058  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  88.27 
 
 		 307 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2607  agmatinase  87.21 
 
 		 306 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564715  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2059  agmatinase  86.41 
 
 		 309 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44506  normal  0.429183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  77.67 
 
 		 310 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000267205  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  63.7 
 
 		 306 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  64.03 
 
 		 306 aa  424  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  64.17 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  63.19 
 
 		 309 aa  421  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0860  agmatinase  63.96 
 
 		 309 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.806171  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0757  agmatinase  61.56 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3279  agmatinase  61.56 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4239  agmatinase  61.56 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3079  agmatinase  61.56 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297049 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0774  agmatinase  61.56 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3370  agmatinase  61.56 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402836  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3343  agmatinase  62.21 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0875816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02767  agmatinase  61.24 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  61.89 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  61.89 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02730  hypothetical protein  61.24 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  61.89 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  61.89 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  61.89 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3095  agmatinase  61.24 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  52.4 
 
 		 321 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  50 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4051  agmatinase  54.24 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2576  agmatinase  49.66 
 
 		 319 aa  298  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  49.66 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4379  agmatinase  48.97 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0643  agmatinase  46.1 
 
 		 320 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0735  agmatinase  46.1 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2027  agmatinase  46.1 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1162  agmatinase  46.26 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.93153  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1941  agmatinase  47.94 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4066  agmatinase  44.93 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109687  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  45.61 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  45.61 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  46.67 
 
 		 342 aa  241  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  45.27 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  44.93 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0860  agmatinase  43.23 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.316189  normal  0.182597 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2499  agmatinase  42.86 
 
 		 316 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  43.92 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_004310  BR0789  agmatinase  41.88 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675091  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1675  agmatinase  42.76 
 
 		 317 aa  231  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5361  agmatinase  42.71 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1319  agmatinase  42.43 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1231  agmatinase  42.11 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1735  agmatinase  45.12 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.252454  normal  0.73109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2340  agmatinase  45.08 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.29773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0946  agmatinase  45.49 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0784  agmatinase  44.36 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.782566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3492  putative agmatinase  44.07 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0949327  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  42.14 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1111  agmatinase  43.29 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0272182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  41.87 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  41.79 
 
 		 342 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  41.67 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  40.79 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  41.61 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1554  agmatinase  43.05 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  42.55 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  41.1 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2909  agmatinase  42.72 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.542381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  43.93 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  43.93 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  43.93 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  40.71 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  41.07 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  41.79 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  41.79 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  41.79 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  41.43 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  42.05 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  41.43 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  41.43 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  41.43 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5662  putative agmatinase  41.11 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5283  agmatinase  41.11 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  41.11 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  40.07 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  41.43 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  39.64 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  39.64 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  40.66 
 
 		 333 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  39.64 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  39.64 
 
 		 316 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0290  agmatinase  43.33 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  38.96 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  39.23 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  39.64 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3294  putative agmatinase  42.35 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  40.86 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  40.06 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3283  agmatinase, putative  42.35 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3345  putative agmatinase  42.35 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  40.89 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1728  agmatinase  40.85 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>