More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1948 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 524 aa  1026    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  57.39 
 
 		 517 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  53.9 
 
 		 526 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  51.84 
 
 		 528 aa  494  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  54.9 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 558 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  52.41 
 
 		 529 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  57.48 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  55.29 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  57.26 
 
 		 496 aa  459  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  47.84 
 
 		 518 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  55.6 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  58.51 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  49.81 
 
 		 562 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  53.02 
 
 		 501 aa  448  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 528 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 509 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  51.97 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 509 aa  425  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  50.3 
 
 		 508 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 506 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  44.93 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  54.51 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 514 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 541 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  54.76 
 
 		 528 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 584 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  50.91 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 532 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  45.31 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  46.38 
 
 		 554 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  49.46 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  46.3 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  41.02 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 		 535 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.97 
 
 		 537 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 		 601 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  49.69 
 
 		 563 aa  359  8e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 533 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 521 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 555 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  41.53 
 
 		 519 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  45.6 
 
 		 508 aa  335  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  43.92 
 
 		 524 aa  333  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  46.07 
 
 		 535 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 513 aa  329  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 490 aa  326  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  42.57 
 
 		 505 aa  317  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 		 536 aa  316  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  39.43 
 
 		 492 aa  287  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 517 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 511 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 503 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.5 
 
 		 516 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 		 525 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 495 aa  256  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 514 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  38.49 
 
 		 517 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.34 
 
 		 534 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 538 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 		 501 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  41.28 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  33.67 
 
 		 500 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  38.46 
 
 		 528 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  38.81 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 		 519 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  35.82 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 594 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 510 aa  231  4e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 519 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  36.06 
 
 		 507 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.06 
 
 		 503 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 		 503 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  34.89 
 
 		 502 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.45 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  35.32 
 
 		 495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 509 aa  217  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.74 
 
 		 495 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  35.74 
 
 		 495 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  35.74 
 
 		 495 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  35.74 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>