106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0903 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  100 
 
 		 778 aa  1585    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  29.32 
 
 		 736 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  29.63 
 
 		 744 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  30.64 
 
 		 739 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  38.55 
 
 		 848 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  39.33 
 
 		 746 aa  188  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  38.41 
 
 		 813 aa  183  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  41.22 
 
 		 275 aa  180  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  38.78 
 
 		 278 aa  178  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  36.95 
 
 		 277 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  36.16 
 
 		 297 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  38.87 
 
 		 818 aa  164  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  36.21 
 
 		 272 aa  160  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  35.96 
 
 		 782 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  39.58 
 
 		 271 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1880  virulence-associated E family protein  26.9 
 
 		 835 aa  148  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00331522  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0404  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  26.49 
 
 		 431 aa  131  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.98615 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  40.91 
 
 		 955 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  28.12 
 
 		 408 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  38.04 
 
 		 953 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  40.36 
 
 		 958 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  40.36 
 
 		 958 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  33.93 
 
 		 1557 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  39.46 
 
 		 953 aa  121  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  39.37 
 
 		 950 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3057  virulence-associated E family protein  29.14 
 
 		 789 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2569  virulence-associated E  31.62 
 
 		 697 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00313413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0098  DNA primase  31.8 
 
 		 1255 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  32.94 
 
 		 1389 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  39.82 
 
 		 955 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  40.27 
 
 		 950 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  30.23 
 
 		 986 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  32.34 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1053  virulence-associated E family protein  28.3 
 
 		 815 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.957725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1072  virulence-associated E family protein  28.3 
 
 		 815 aa  112  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  32.34 
 
 		 621 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  29.02 
 
 		 833 aa  110  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3094  virulence-associated E  29.58 
 
 		 662 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000820429  normal  0.712426 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  24.78 
 
 		 357 aa  108  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  24.78 
 
 		 411 aa  108  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0652  TOPRIM domain-containing protein  32.73 
 
 		 326 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0494563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  32.36 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  36.82 
 
 		 368 aa  105  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  31.68 
 
 		 1495 aa  104  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2155  virulence-associated E  31.88 
 
 		 695 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00489763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0384  virulence-associated protein E  28.14 
 
 		 788 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.469306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2850  virulence-associated E family protein  28.14 
 
 		 788 aa  101  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000089982  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1580 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1504  hypothetical protein  30.58 
 
 		 326 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  37.67 
 
 		 797 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6195  hypothetical protein  31.74 
 
 		 523 aa  97.8  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374342  normal  0.646771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3284  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  32.04 
 
 		 748 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.832553  normal  0.553227 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  27.24 
 
 		 1448 aa  95.9  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1448 aa  95.1  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1196  virulence-associated E family protein  28.81 
 
 		 818 aa  94.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1098  virulence-associated protein E, putative  28.57 
 
 		 789 aa  94.4  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0611  Cpp22  25.14 
 
 		 430 aa  92.8  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5333  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like protein  31.55 
 
 		 749 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  29.8 
 
 		 896 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  26.32 
 
 		 812 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  33.67 
 
 		 338 aa  89.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1077 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  32.93 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1413  virulence-associated E family protein  27.27 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0173  Primase 2  32.81 
 
 		 637 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.214274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3095  virulence-associated E family protein  27.18 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1237  virulence-associated E family protein  25.35 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000496901  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4191  primase 2  35.25 
 
 		 615 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6494  Primase 2  36.12 
 
 		 621 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.921039 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4842  hypothetical protein  35.25 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3324  hypothetical protein  35.25 
 
 		 615 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  26.32 
 
 		 892 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  32.95 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1984  virulence-associated E family protein  28.05 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  30.05 
 
 		 890 aa  77.8  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0459  putative DNA replication primase  31.93 
 
 		 644 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  34.73 
 
 		 775 aa  77.4  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5640  virulence-associated E family protein  26.76 
 
 		 761 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000885028  normal  1 
 
 
 
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  31.15 
 
 		 777 aa  75.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  29.06 
 
 		 890 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  30.71 
 
 		 777 aa  72.4  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1690  virulence-associated E family protein  36.7 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.879464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  29.75 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  33.53 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  25.95 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40670  DnaG-like primase protein  38.14 
 
 		 128 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.62 
 
 		 678 aa  67.4  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4941  hypothetical protein  23.7 
 
 		 736 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1431  P-loop ATPase and inactivated derivatives-like  34.85 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.150716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  33.92 
 
 		 763 aa  65.1  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  31.73 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  33.92 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  30 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 273 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  31.73 
 
 		 777 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  31.73 
 
 		 777 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  27.14 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  30.37 
 
 		 899 aa  61.6  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  30.3 
 
 		 878 aa  60.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0427  virulence-associated protein E  26.9 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>