More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1903 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  43.7 
 
 		 941 aa  712    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  42.84 
 
 		 1135 aa  684    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  43.23 
 
 		 1151 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  39.56 
 
 		 984 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  49.72 
 
 		 1182 aa  867    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  46.5 
 
 		 1143 aa  753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  42.19 
 
 		 1142 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 918 aa  1906    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  38.58 
 
 		 918 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1138 aa  617  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  37.24 
 
 		 909 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  40.09 
 
 		 908 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.26 
 
 		 1200 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  41.12 
 
 		 1505 aa  475  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  41.23 
 
 		 1444 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.04 
 
 		 945 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.79 
 
 		 953 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 800 aa  360  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  31.23 
 
 		 1194 aa  261  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.59 
 
 		 1029 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  25.67 
 
 		 1081 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  22.87 
 
 		 892 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  24.69 
 
 		 1132 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  24.62 
 
 		 841 aa  114  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.26 
 
 		 396 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  25.86 
 
 		 999 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  25.86 
 
 		 999 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  26.04 
 
 		 999 aa  111  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.08 
 
 		 1657 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  26.84 
 
 		 712 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.58 
 
 		 442 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  28.81 
 
 		 411 aa  106  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  32.91 
 
 		 422 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.78 
 
 		 412 aa  105  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  28.26 
 
 		 387 aa  104  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.63 
 
 		 367 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  28.8 
 
 		 430 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  32.17 
 
 		 371 aa  102  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  30.27 
 
 		 471 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.46 
 
 		 387 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  28.67 
 
 		 387 aa  100  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  23.62 
 
 		 388 aa  99  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.18 
 
 		 374 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 413 aa  97.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  28.85 
 
 		 386 aa  97.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.18 
 
 		 374 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  23.17 
 
 		 388 aa  96.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 		 382 aa  96.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  29.24 
 
 		 419 aa  95.9  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  29.47 
 
 		 394 aa  95.5  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.47 
 
 		 369 aa  95.1  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  28.65 
 
 		 395 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  27.76 
 
 		 407 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  28.36 
 
 		 395 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.1 
 
 		 570 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0897  soluble aldose sugar dehydrogenase yliI  27.1 
 
 		 373 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  24.37 
 
 		 530 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0371  glucose sorbosone dehydrogenase  30.86 
 
 		 410 aa  90.5  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  26.2 
 
 		 342 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 399 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 376 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  26.24 
 
 		 392 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  28.04 
 
 		 369 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  27.36 
 
 		 391 aa  89  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  25.09 
 
 		 585 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  27.39 
 
 		 387 aa  89  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  51.95 
 
 		 138 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  27.07 
 
 		 377 aa  88.6  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1520  glucose sorbosone dehydrogenase  27.13 
 
 		 400 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0233321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  23.31 
 
 		 374 aa  88.2  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.47 
 
 		 450 aa  87.8  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 		 408 aa  87.8  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.14 
 
 		 367 aa  87.8  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2982  hypothetical protein  29.43 
 
 		 382 aa  87.8  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2839  glucose sorbosone dehydrogenase  26.86 
 
 		 397 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  23.66 
 
 		 376 aa  87.4  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  28.25 
 
 		 418 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.09 
 
 		 414 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  22.6 
 
 		 405 aa  86.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2895  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  27.1 
 
 		 370 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0439  glucose sorbosone dehydrogenase  26.92 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.369001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  25.61 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  25.68 
 
 		 2172 aa  85.1  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  30 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  30.21 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2857  glucose sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0865  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  25.19 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2984  glucose sorbosone dehydrogenase  26.35 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.57 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  24.07 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00804  predicted dehydrogenase  25.19 
 
 		 371 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  25.19 
 
 		 371 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0909  aldose sugar dehydrogenase yliI  25.19 
 
 		 371 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00821  hypothetical protein  25.19 
 
 		 371 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0991  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  25.19 
 
 		 371 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.657976 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00578  Glucose dehydrogenase, putative  25.42 
 
 		 389 aa  84  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2805  glucose sorbosone dehydrogenase  25.19 
 
 		 371 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2507  glucose / sorbosone dehydrogenase protein  25.19 
 
 		 371 aa  83.2  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  24.65 
 
 		 378 aa  83.2  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>