More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_22970  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  100 
 
 		 423 aa  822    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.376006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1263  response regulator receiver modulated serine phosphatase  54.52 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.799731  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1576  response regulator receiver modulated serine phosphatase  53.98 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0296276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5033  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.31 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1126  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.83 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5361  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.22 
 
 		 392 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0290  response regulator receiver modulated serine phosphatase  46.55 
 
 		 390 aa  263  6e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.639758  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6523  response regulator receiver modulated serine phosphatase  44.33 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98735  normal  0.0636909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.85 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2344  response regulator receiver:protein phosphatase 2C-like  40 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8460  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  42.16 
 
 		 394 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0056  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.49 
 
 		 418 aa  229  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2688  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.68 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2718  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453118  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2732  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276002  normal  0.519614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.56 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3268  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2987  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143541  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0788  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 		 634 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 746 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2816  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 		 682 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0864703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.35 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.7 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3357  response regulator receiver protein  45.51 
 
 		 283 aa  94  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 653 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.03 
 
 		 564 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.23 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  23.23 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.57 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.23 
 
 		 380 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.62 
 
 		 941 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.94 
 
 		 566 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.63 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  22.95 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  21.88 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.16 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.16 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 1711 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  22.44 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 759 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.1 
 
 		 728 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4118  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.33 
 
 		 847 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.31 
 
 		 637 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  22.16 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  23.23 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  23.23 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.47 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.56 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 874 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4645  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 644 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  29.34 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.48 
 
 		 602 aa  83.2  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1518  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 769 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4150  response regulator receiver protein  44.37 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0666389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.76 
 
 		 549 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  27.74 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  25.72 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  27.68 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.15 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  29.43 
 
 		 1017 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.69 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1432  sensory box histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.188442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1842  response regulator/sensory box histidine kinase  38.1 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.44 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1932  Signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.56 
 
 		 738 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0472  sensory box histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.798891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.52 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0176  sensory box histidine kinase/response regulator  38.1 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.81 
 
 		 827 aa  76.6  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  25.33 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4365  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  32.24 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1009  sensory box histidine kinase/response regulator  43.9 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  24.57 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  34.57 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.83 
 
 		 697 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  37.12 
 
 		 776 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  26.56 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  30.98 
 
 		 637 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0910  sensory box histidine kinase/response regulator  42.68 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3436  protein serine/threonine phosphatase  29.25 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0380  sensory box histidine kinase/response regulator  42.68 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.24 
 
 		 572 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.71 
 
 		 523 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.11 
 
 		 753 aa  73.2  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.75 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  34.31 
 
 		 797 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>