137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3457 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  43.07 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  36.76 
 
 		 327 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  37.37 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  35.19 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  36.14 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  44.88 
 
 		 175 aa  95.5  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  36.96 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  32.27 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  26.96 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  33.59 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  37.98 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  34.4 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  34.4 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  37.41 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  38.93 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.5 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  34.15 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  34.69 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  32.66 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.12 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  38.58 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  34.52 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  29.68 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  34.21 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  33.77 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  39.23 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  37.21 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.97 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  38.58 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  34.04 
 
 		 350 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  40 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0608  nuclease  29.38 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.16 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  34.06 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  32.72 
 
 		 247 aa  68.6  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.57 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  35.25 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  37.23 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.49 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  32.82 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.79 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.13 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  31.79 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  32.82 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  37.72 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  40 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.47 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  35.88 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  31.43 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  32.84 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  32.64 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  32.64 
 
 		 228 aa  62  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  30.99 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  28.47 
 
 		 183 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.2 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  35.04 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.59 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  28.47 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  31.3 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1710  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  47.27 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.658274  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  32.81 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  38.26 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  30.95 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  28.12 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  27.07 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.41 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  36.56 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  25.87 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.82 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  33.59 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  32.82 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.7 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  32.03 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  32.82 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  34.03 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  24.44 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.43 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  27.91 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  32.73 
 
 		 171 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  26.97 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  30.94 
 
 		 175 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  30.77 
 
 		 408 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.82 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  26.25 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.08 
 
 		 169 aa  52.8  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  29.59 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  29.71 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  30.26 
 
 		 166 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  28.95 
 
 		 169 aa  52  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  36.59 
 
 		 282 aa  52  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  27.27 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.82 
 
 		 156 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30.51 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.85 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  34.68 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  29.08 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.5 
 
 		 388 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>