274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0414 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  43.68 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  43.68 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  43.68 
 
 		 288 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  44.32 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  38.72 
 
 		 409 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  39.92 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  36.26 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  37.19 
 
 		 381 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  39.68 
 
 		 381 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  38.37 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  38.2 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  40.66 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  40.66 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  33.46 
 
 		 792 aa  135  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  30.42 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  31.97 
 
 		 396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  31.23 
 
 		 1016 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  35.57 
 
 		 391 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12160  ribonuclease D  30.8 
 
 		 392 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  35.94 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  30.07 
 
 		 392 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  35.42 
 
 		 420 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  34.23 
 
 		 408 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3324  ribonuclease D  28.87 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.342463  normal  0.392849 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  37.27 
 
 		 176 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  32.5 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  31.15 
 
 		 420 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  33.97 
 
 		 403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  29.26 
 
 		 386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  30.22 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  30 
 
 		 437 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1064  ribonuclease D (rnase d)  32.53 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409138  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0799  ribonuclease D  27.05 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.42118  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1933  ribonuclease D  33.59 
 
 		 371 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000115292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2522  ribonuclease D  30.74 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000280385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2580  ribonuclease D  31.15 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2187  ribonuclease D  31.07 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000120269  hitchhiker  0.0000305333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2176  ribonuclease D  31.25 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000267525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2253  ribonuclease D  31.25 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000377901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  30.92 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2385  ribonuclease D  30.77 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000005746  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3518  ribonuclease D  29.81 
 
 		 379 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  28.08 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  28.52 
 
 		 393 aa  108  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  28.24 
 
 		 1297 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  32.5 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  29.59 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  29.32 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  27.84 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  31.05 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1121  ribonuclease D  28.83 
 
 		 392 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  30.88 
 
 		 426 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2111  ribonuclease D  29.57 
 
 		 369 aa  106  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000446325  normal  0.381908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  32.35 
 
 		 407 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  31.85 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2803  ribonuclease D  30.34 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  31.82 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  31.33 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  28.62 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1102  ribonuclease D  25.98 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.447104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  32.54 
 
 		 442 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  32.92 
 
 		 417 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  30.68 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  35.34 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1899  ribonuclease D  28.95 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000359973  normal  0.61142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  31.97 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  29.96 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1892  ribonuclease D  28.95 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000212189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2427  ribonuclease D  28.95 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000162598  normal  0.100948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  33.33 
 
 		 414 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3861  ribonuclease D (RNase D)  26.24 
 
 		 384 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.623671  normal  0.66998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  32.55 
 
 		 451 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3138  ribonuclease D  26.46 
 
 		 382 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1249  ribonuclease D  25.89 
 
 		 381 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606694  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  30.8 
 
 		 499 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1588  ribonuclease D  25.62 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1582  3'-5' exonuclease  29.81 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  30.24 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  31.92 
 
 		 437 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  29.85 
 
 		 377 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1389  ribonuclease D  29.97 
 
 		 388 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1762  ribonuclease D  31.64 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000618336  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  32.41 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  27.88 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1865  ribonuclease D  28.95 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000800647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  31.09 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2949  ribonuclease D  25.89 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  32.39 
 
 		 476 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  30.34 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0208  ribonuclease D  27.52 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.790947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  28.26 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2261  3'-5' exonuclease  32.34 
 
 		 447 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  32.55 
 
 		 451 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  29.56 
 
 		 424 aa  99  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  33.63 
 
 		 427 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  30.85 
 
 		 395 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0744  ribonuclease D  27.18 
 
 		 385 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0750  ribonuclease D  27.18 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  29.18 
 
 		 428 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>