197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4448 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4448  lexA DNA binding domain protein  100 
 
 
108 aa  222  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0015739  unclonable  1.08771e-09 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0386  LexA repressor  44.44 
 
 
210 aa  79  2e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2008  LexA repressor  48.68 
 
 
218 aa  77.4  6e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.196928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2007  LexA repressor  53.52 
 
 
202 aa  75.1  3e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.417718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04014  LexA repressor  44.57 
 
 
208 aa  75.1  3e-13  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  53.03 
 
 
212 aa  75.1  3e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1741  SOS-response transcriptional repressor, LexA  49.3 
 
 
226 aa  75.1  3e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1096  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.68 
 
 
208 aa  75.1  3e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0403674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1240  LexA repressor  50.7 
 
 
216 aa  74.7  4e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0593225  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  54.41 
 
 
215 aa  74.3  5e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1772  LexA repressor  50 
 
 
216 aa  74.3  5e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1787  LexA repressor  47.95 
 
 
201 aa  74.3  5e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.916871  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  50 
 
 
216 aa  74.3  5e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  54.41 
 
 
215 aa  73.9  6e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  54.41 
 
 
215 aa  73.9  6e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1516  LexA repressor  54.41 
 
 
215 aa  73.9  6e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.984097  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  54.41 
 
 
215 aa  73.9  6e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  54.41 
 
 
215 aa  73.9  6e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1981  LexA repressor  47.3 
 
 
218 aa  74.3  6e-13  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0274768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  54.41 
 
 
215 aa  73.9  6e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1630  LexA repressor  52 
 
 
216 aa  73.9  7e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  50.7 
 
 
216 aa  73.6  8e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3789  LexA repressor  43.33 
 
 
206 aa  73.6  8e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3989  LexA repressor  43.33 
 
 
206 aa  73.6  8e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3398  LexA repressor  44.44 
 
 
203 aa  73.6  9e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3862  LexA repressor  43.33 
 
 
206 aa  73.2  1e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4603  LexA repressor  43.33 
 
 
206 aa  73.2  1e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3524  LexA repressor  44.44 
 
 
203 aa  73.2  1e-12  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  52.94 
 
 
215 aa  72  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  52.94 
 
 
215 aa  72  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  52.94 
 
 
215 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  52.94 
 
 
215 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  52.94 
 
 
215 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  52.94 
 
 
215 aa  72  2e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  51.47 
 
 
216 aa  72  2e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2481  LexA repressor  52.94 
 
 
235 aa  71.6  3e-12  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147016  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  52.94 
 
 
202 aa  72  3e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  52.94 
 
 
202 aa  72  3e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  45.56 
 
 
202 aa  71.6  3e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00268  LexA repressor  43.33 
 
 
206 aa  71.6  4e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2012  LexA repressor  52.94 
 
 
235 aa  71.6  4e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  51.47 
 
 
202 aa  71.2  4e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2117  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.37 
 
 
207 aa  70.9  6e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  hitchhiker  3.26173e-07 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  50 
 
 
202 aa  70.1  9e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  50 
 
 
202 aa  70.1  9e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  50 
 
 
202 aa  70.1  9e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2082  LexA repressor  52.24 
 
 
231 aa  70.1  9e-12  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  50 
 
 
202 aa  70.1  9e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  50 
 
 
202 aa  70.1  9e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  3.08575e-07 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  50 
 
 
202 aa  70.1  1e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4912  LexA repressor  50.75 
 
 
224 aa  69.7  1e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  44.44 
 
 
202 aa  69.7  1e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3481  LexA repressor  42.86 
 
 
207 aa  69.3  1e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  44.44 
 
 
202 aa  69.7  1e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  44.44 
 
 
202 aa  69.7  1e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0156  LexA repressor  42.22 
 
 
206 aa  69.3  2e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4309  LexA repressor  42.22 
 
 
206 aa  69.3  2e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4110  LexA repressor  42.22 
 
 
206 aa  69.3  2e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2423  LexA repressor  43.01 
 
 
209 aa  68.9  2e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  50.75 
 
 
224 aa  69.3  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4178  LexA repressor  42.22 
 
 
206 aa  69.3  2e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002149  SOS-response repressor and protease LexA  43.62 
 
 
207 aa  68.2  3e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0260  LexA repressor  50 
 
 
204 aa  68.6  3e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.712768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1866  LexA repressor  50.75 
 
 
225 aa  68.2  4e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.306175  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4247  LexA repressor  41.76 
 
 
207 aa  68.2  4e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  41.11 
 
 
206 aa  67.4  6e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  45.59 
 
 
211 aa  67.4  6e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  52.31 
 
 
227 aa  67.4  7e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0418  SOS-response transcriptional repressor, LexA  48.48 
 
 
239 aa  67  8e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  2.2739e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2994  LexA repressor  50.75 
 
 
224 aa  67  9e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.487407  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  50.75 
 
 
234 aa  66.2  1e-10  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  50.77 
 
 
224 aa  66.2  1e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2152  LexA repressor  35.96 
 
 
204 aa  66.6  1e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0108  SOS-response transcriptional repressor, LexA  50 
 
 
209 aa  66.6  1e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341365  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  50 
 
 
202 aa  66.6  1e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2440  transcriptional repressor, LexA family  46.38 
 
 
70 aa  66.2  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  2.54374e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0127  LexA repressor  44.74 
 
 
205 aa  66.2  1e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  35.96 
 
 
204 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  50.77 
 
 
224 aa  66.2  1e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  40 
 
 
206 aa  65.9  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0426  transcriptional repressor, LexA family  46.97 
 
 
239 aa  65.5  2e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  49.25 
 
 
234 aa  65.9  2e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  48.53 
 
 
205 aa  66.2  2e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3780  LexA repressor  48.53 
 
 
206 aa  65.9  2e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0180  LexA repressor  48.53 
 
 
205 aa  65.5  3e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  38.2 
 
 
202 aa  65.1  3e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  49.23 
 
 
224 aa  65.1  3e-10  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  43.04 
 
 
202 aa  65.1  3e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  47.69 
 
 
201 aa  63.9  6e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  44.12 
 
 
202 aa  62.8  1e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2893  LexA repressor  43.59 
 
 
207 aa  63.5  1e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  44.12 
 
 
202 aa  62.8  1e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>