192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0045 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0045  flagellar basal body rod protein-like protein  100 
 
 		 215 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  25.3 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  25.99 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  25.99 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0252  flagellar basal body rod protein FlgF  27.75 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0148994  normal  0.447091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  23.61 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  25.51 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4121  protein of unknown function DUF1078 domain protein  24.23 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00427548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0301  flagellar basal body rod protein FlgF  25.68 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.859082  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3477  flagellar basal body rod protein  28.85 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.44174  normal  0.204682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0346  flagellar basal body rod protein FlgF  23.68 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0480066 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  26.43 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  27.62 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2387  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  23.21 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0314  flagellar basal body rod protein FlgF  29.84 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  26.05 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1344  flagellar basal body rod protein FlgF  26.09 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4198  flagellar basal body rod protein FlgF  25.11 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  27.75 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  22.61 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  35.34 
 
 		 430 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  26.58 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  25.88 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 		 442 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  22.7 
 
 		 282 aa  52  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  25.74 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  24.03 
 
 		 282 aa  51.6  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4787  flagellar basal-body rod protein FlgF  27.27 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3710  flagellar basal-body rod protein FlgF  27.27 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.414142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  26.14 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4123  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.69 
 
 		 329 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1684  flagellar basal body rod protein FlgF  27.27 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.081345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1020  flagellar distal rod protein FlgG  28.75 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  24.78 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 		 402 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0796  flagellar basal-body rod protein  30.66 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5630  flagellar basal body rod protein FlgG  29.03 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  23.11 
 
 		 246 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1309  flagellar basal-body rod protein  30.66 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000564283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0258  flagellar basal body rod protein FlgG  32 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01007  flagellar basal body rod protein FlgG  26.29 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06159  flagellar basal body rod protein FlgG  26.29 
 
 		 261 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.96 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  34.48 
 
 		 430 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2373  hypothetical protein  26.97 
 
 		 261 aa  49.3  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.69 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.69 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2919  flagellar basal body rod protein FlgG  34.15 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0794239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0720  flagellar basal-body rod protein  30.66 
 
 		 270 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000227906  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0154  flagellar basal body rod protein FlgG  28.95 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1327  flagellar basal body rod protein FlgF  23.18 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1222  flagellar basal-body rod protein FlgG  23.72 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0060  protein of unknown function DUF1078-like protein  34.82 
 
 		 392 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2604  flagellar basal body rod protein FlgF  31.78 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.729384  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7254  putative flagellar basal-body rod protein flgF  27.39 
 
 		 246 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15646  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0138  flagellar basal body rod protein FlgG  28.95 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.089009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1901  flagellar basal body rod protein FlgG  26.02 
 
 		 261 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2988  flagellar basal body rod protein FlgF  23.18 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  28.3 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1545  fagellar hook-basal body protein  29.41 
 
 		 267 aa  48.1  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.359973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3719  flagellar basal-body rod FlgG  25.21 
 
 		 260 aa  48.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1470  flagellar basal body rod protein FlgG  30.71 
 
 		 261 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185183  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3726  flagellar basal body rod protein FlgG  31.5 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3786  flagellar basal body rod protein FlgF  24.42 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  26.14 
 
 		 253 aa  47.8  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  32.74 
 
 		 422 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  24.08 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0931  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.08 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  28.28 
 
 		 498 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0729  flagellar basal body rod protein FlgF  31.53 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0123  putative flagellar basal-body rod protein flgF  30.94 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  32.73 
 
 		 396 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.43 
 
 		 408 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2208  flagellar basal body rod protein FlgG  32 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1307  flagellar basal body rod protein FlgF  24.12 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1946  flagellar basal body rod protein  40.98 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.704527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0696  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.4 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0511739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  28.44 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  33.62 
 
 		 432 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  27.98 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  24.39 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2114  flagellar basal body rod protein FlgF  29.13 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1657  flagellar basal body rod protein  28.45 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  30.23 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4209  flagellar basal body rod protein FlgG  27.63 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1502  flagellar basal body rod protein FlgG  29.92 
 
 		 261 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1384  flagellar basal body rod protein FlgF  24.89 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0211  flagellar basal-body rod protein FlgG  25.57 
 
 		 261 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.625971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5509  flagellar basal body rod protein FlgF  29.67 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0521919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4385  flagellar basal body rod protein FlgG  29.13 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368986  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1121  flagellar basal body rod protein FlgG  29.03 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.72 
 
 		 501 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  32.74 
 
 		 460 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1097  flagellar basal body rod protein FlgG  28.96 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2961  flagellar basal body rod protein FlgF  23.77 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.812627  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3946  flagellar basal body rod protein FlgG  29.13 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2593  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 260 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1873  flagellar basal body rod protein FlgG  33.33 
 
 		 260 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1229  flagellar basal body rod protein FlgG  21.95 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>