More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1657 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1657  flagellar basal body rod protein  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1564  flagellar basal body rod protein  36.4 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2338  flagellar basal body rod protein  36.76 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0110008  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0334  flagellar basal body rod protein  35.59 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3052  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.69 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0430  hypothetical protein  36.59 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1249  hypothetical protein  34.73 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3448  flagellar basal body rod protein  33.88 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0465  hypothetical protein  34.82 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1206  hypothetical protein  34.45 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0981991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4107  flagellar basal body rod protein  33.2 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2410  flagellar basal-body rod protein FlgF  32.89 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.799148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0110  flagellar basal body rod protein  34 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000015069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16580  flagellar basal body rod protein  34.02 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0921  hypothetical protein  33.47 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3101  flagellar basal body rod protein  30.92 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2023  fagellar hook-basal body protein  29.84 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1432  flagellar basal body rod protein  37.04 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0804  flagellar hook-basal body complex protein  32.73 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3763  flagellar basal body rod protein  33.9 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3281  flagellar basal body rod protein  28.52 
 
 		 278 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000663346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0797  hypothetical protein  30.24 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0243  flagellar basal body rod protein  30.47 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.146878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2620  protein of unknown function DUF1078-like protein  32.64 
 
 		 259 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000392095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0710  flagellar basal-body rod protein FlgF  30.65 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3393  fagellar hook-basal body protein  30.26 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3847  flagellar basal-body rod protein FlgF  33.47 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0397  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.37 
 
 		 261 aa  95.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2922  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.73 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0026  fagellar hook-basal body protein  30.36 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.852017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3159  flagellar basal-body rod protein, putative  34.86 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0561119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2373  flagellar basal-body rod protein (flgG-2)  30.8 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000324941  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1006  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.1 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2429  hypothetical protein  31.89 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1339  fagellar hook-basal body protein  29.58 
 
 		 282 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2842  hypothetical protein  30.56 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2562  flagellar basal body rod protein  30.34 
 
 		 256 aa  89  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421926 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1146  putative flagellar basal-body rod protein FlgF  30.36 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6504  flagellar basal body rod protein  29.82 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.654735  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.73 
 
 		 270 aa  88.2  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3096  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.22 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2517  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.63 
 
 		 259 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1148  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.34 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000141838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  30.8 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1742  flagellar basal body rod protein  26.86 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0922  flagellar basal-body rod protein FlgG  31.25 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3095  flagellar basal body rod protein FlgG  27.2 
 
 		 262 aa  85.5  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2294  flagellar basal body rod protein  28.26 
 
 		 244 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0621  flagellar basal body rod protein FlgG  29.5 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2138  flagellar basal body rod protein  28.26 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0632  flagellar basal body rod protein FlgG  29.5 
 
 		 262 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.158424  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3101  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.15 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0599  flagellar basal body rod protein FlgG  29.5 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.5 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02924  flagellar basal-body rod protein FlgF  27.98 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383778  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4713  flagellar basal body rod protein FlgF  29.49 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2232  flagellar basal body rod protein  28.87 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.3997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.12 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0347  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.25 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332367  normal  0.336633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1481  flagellar basal-body rod protein FlgF  29.32 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  30 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1165  flagellar basal body rod protein FlgF  29.06 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.96 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  30.12 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4121  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.8 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00427548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3676  flagellar basal body rod protein FlgG  30 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605272 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1228  flagellar basal body rod protein FlgF  29.88 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3083  flagellar basal body rod protein FlgF  28.27 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.97 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374892  normal  0.0910143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0628  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.46 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.98 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4215  flagellar basal body rod protein FlgF  29.78 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.369862  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3245  flagellar basal body rod protein FlgF  28.57 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1228  flagellar basal body rod protein FlgF  30.04 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.46 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0352  flagellar basal body rod protein FlgG  30.43 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2593  flagellar basal body rod protein FlgF  28.27 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.46 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0593  fagellar hook-basal body protein  27.62 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04914  flagellar basal body rod protein  28.97 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0064  flagellar basal-body rod protein FlgG  29.2 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  29.25 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1958  flagellar basal-body rod FlgF  31.03 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3739  flagellar basal body rod protein FlgG  26.64 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3709  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.91 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.409593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1263  flagellar basal body rod protein FlgF  29.06 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1333  flagellar basal body rod protein FlgF  29.06 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4786  flagellar basal-body rod protein FlgG  27.91 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0320  flagellar basal body rod protein FlgG  30.04 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  31.86 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1349  flagellar basal body rod protein FlgF  27.54 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1325  flagellar basal body rod protein FlgF  28.57 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0391  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.27 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1557  flagellar basal body rod protein  26.72 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2943  flagellar basal body rod protein FlgF  28.14 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1325  flagellar basal body rod protein FlgF  30.47 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  28.9 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3158  flagellar basal body rod protein FlgG  32.79 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0542241  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0128  flagellar basal body rod protein FlgF  28.89 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.350872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2958  flagellar basal body rod protein FlgF  28.14 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>