146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0092 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  895    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  52.86 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  55.47 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  47.39 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  45.48 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  46.31 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  46.54 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  45.18 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  44.37 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  44.47 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  43.87 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  42.13 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  39.9 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  33.16 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.73 
 
 		 444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  30.5 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  30.98 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.98 
 
 		 391 aa  163  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  30.18 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.11 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  30.15 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  30.15 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.95 
 
 		 411 aa  143  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  29.62 
 
 		 418 aa  142  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.17 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  31.14 
 
 		 429 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  29.78 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  28.71 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.98 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  30.58 
 
 		 295 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  26.1 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  27.44 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.68 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  27.21 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  27 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.19 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  26.37 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  27.06 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.8 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  26.51 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  27.87 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  26.77 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  30.77 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  27.18 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  27.52 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.19 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  27.68 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  25.76 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  24.78 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.78 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  28.61 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.25 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  28.35 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.79 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  24.66 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  27.05 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  24.64 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  25 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  23.92 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  26.96 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.32 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.3 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  22.19 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.63 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.84 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  22.54 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.11 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  23.63 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  25.41 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  25.85 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.14 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.14 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  21.67 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.37 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  26.04 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  23.4 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.65 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  23.17 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.18 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  28.97 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  25 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  26.49 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  27.27 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  26.42 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  23.4 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  22.56 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  28 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  26.7 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  28 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  23.87 
 
 		 312 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.14 
 
 		 438 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>