More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0497 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0497  isochorismatase  100 
 
 		 285 aa  590  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0615  isochorismatase  98.95 
 
 		 285 aa  583  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00562  isochorismatase  98.25 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0615  isochorismatase  98.25 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3049  isochorismatase  98.6 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3031  Isochorismatase  98.6 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0773694  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00551  hypothetical protein  98.25 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0680  isochorismatase  98.6 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0646  isochorismatase  98.6 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0709  isochorismatase  87.72 
 
 		 285 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0693  isochorismatase  87.72 
 
 		 285 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0544005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0650  isochorismatase  87.72 
 
 		 285 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.394941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0755  isochorismatase  87.37 
 
 		 285 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0636  isochorismatase  87.37 
 
 		 285 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.529222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1127  isochorismatase  85.26 
 
 		 284 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.78155 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  71.63 
 
 		 284 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3075  Isochorismatase  61.84 
 
 		 283 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  65.61 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3737  Isochorismatase  60.35 
 
 		 287 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  61.89 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1488  Isochorismatase  61.05 
 
 		 291 aa  351  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1623  isochorismatase  49.65 
 
 		 294 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0011  isochorismatase  50.87 
 
 		 290 aa  289  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0014  isochorismatase  50.52 
 
 		 290 aa  285  8e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1688  isochorismatase  49.32 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01400  hypothetical protein  45.95 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1633  isochorismatase  49.29 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.741759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  48.75 
 
 		 285 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  44.71 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  44.22 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  44.22 
 
 		 297 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  44.22 
 
 		 297 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1757  isochorismatase  44.03 
 
 		 297 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  46.18 
 
 		 278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  44.44 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  44.44 
 
 		 295 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  44.18 
 
 		 295 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2020  Isochorismatase  46.18 
 
 		 327 aa  257  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  43.75 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  43.49 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  43.15 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0300  vibriobactin-specific isochorismatase  44.44 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3398  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.57 
 
 		 319 aa  241  7e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.877818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4517  Isochorismatase  43.93 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0854909  normal  0.417709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1569  isochorismatase  50.49 
 
 		 207 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0910481  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1027  Isochorismatase  46.41 
 
 		 212 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.553092  decreased coverage  0.000215707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3684  isochorismatase hydrolase  51.94 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  47.95 
 
 		 221 aa  209  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3619  isochorismatase  46.86 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  40.7 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0639  Isochorismatase  49.76 
 
 		 216 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.316933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09450  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.63 
 
 		 207 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39925  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.15 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  45.15 
 
 		 207 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  45.19 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0886  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.15 
 
 		 207 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  48.15 
 
 		 220 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3382  phenazine biosynthesis protein PhzD  45.15 
 
 		 207 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2383  isochorismatase  44.98 
 
 		 218 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231944  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  44.02 
 
 		 221 aa  188  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4467  Isochorismatase  38.16 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.813691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0113  Isochorismatase  35.44 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.662986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.17 
 
 		 180 aa  89.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  35.6 
 
 		 194 aa  85.9  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  35.6 
 
 		 194 aa  85.9  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 201 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  25.41 
 
 		 190 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  32.53 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 209 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 237 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  26.06 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.04 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  26.8 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  27.54 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  27.65 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  25.27 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  26.7 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  25.49 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.23 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  26.7 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  26.87 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>