More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0417 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  795    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  81.84 
 
 		 425 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  61 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  59.23 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  60.79 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  48.79 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  52.32 
 
 		 432 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  48.93 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 402 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  32.09 
 
 		 411 aa  136  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  40.68 
 
 		 289 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 420 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  30.25 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.72 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  34.07 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.97 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.97 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.97 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.97 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.97 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 397 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  28.85 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  28.61 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.56 
 
 		 408 aa  97.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  28.61 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.27 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.27 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.27 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 416 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  26.03 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  27.13 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 360 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.72 
 
 		 410 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.48 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.15 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.4 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  25.52 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.53 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.97 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  27.93 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.42 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.76 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  27.52 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  22.44 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  27.19 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.41 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>