273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0709 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  70.32 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  75.62 
 
 		 283 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  47.81 
 
 		 279 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  40.07 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  40.99 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  41.18 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  40.29 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  40.36 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  37.41 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  33.65 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  31.03 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 329 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 322 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  32.79 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  33.15 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  31.69 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  30.18 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  31.35 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  29.12 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 660 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  28.12 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  24.81 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  31.44 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  26.15 
 
 		 335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  34.39 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  30.04 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.82 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  30 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  31.61 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  29.44 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.44 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 320 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 322 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  32.4 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 323 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.93 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  29.84 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  31.82 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  29.26 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  28.79 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  30.24 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  35.42 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  29.67 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  34.72 
 
 		 320 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  32.53 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 337 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 337 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 336 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  28.19 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  27.36 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  30.37 
 
 		 323 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  29.38 
 
 		 324 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 535 aa  97.4  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7219  type II secretion system protein  25.18 
 
 		 287 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.981655  normal  0.304711 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 325 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 317 aa  92.4  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  32.37 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 327 aa  92  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.04 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  35.46 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  29.94 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 329 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  26.52 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>