131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0538 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  46.03 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  46.31 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  47.18 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  46.31 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  45.48 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  43.52 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  41.72 
 
 		 302 aa  232  6e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  36.97 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 		 295 aa  159  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  39.41 
 
 		 239 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 680 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.19 
 
 		 312 aa  143  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  34.84 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  31.77 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  31.35 
 
 		 313 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  34.11 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  27.51 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  32.1 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  32.39 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  28.29 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 231 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  25 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1943  radical SAM family protein  28.03 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.545667  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  22.22 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0855  hypothetical protein  27.78 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  6.94924e-18  unclonable  0.0000000890564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  25.64 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  22.58 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  23.08 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.68 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1830  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  27.2 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 		 336 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  28.57 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0471  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.2 
 
 		 341 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.918131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1985  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.32 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2243  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.787846  hitchhiker  0.00358781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.67 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.71 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0121  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 461 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0923  hypothetical protein  32.91 
 
 		 77 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000601668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3837  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.91 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  29.13 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  27.27 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  27.67 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.06 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 		 348 aa  45.8  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.78 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.41 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  23.72 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2659  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.78 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00949388  normal  0.0744844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  30.77 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  21.3 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2450  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  22.7 
 
 		 358 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.93 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2165  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774157  hitchhiker  0.00100207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.24 
 
 		 375 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.15 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00708242  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  28.32 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>