194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0930 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  100 
 
 
840 aa  1698  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  72.74 
 
 
840 aa  1277  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  72.74 
 
 
840 aa  1277  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  34.61 
 
 
861 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  35.03 
 
 
861 aa  512  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  34.45 
 
 
859 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41179e-10 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  35.27 
 
 
861 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  35.27 
 
 
861 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  35.03 
 
 
861 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  35.03 
 
 
861 aa  512  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  35.15 
 
 
859 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  35.03 
 
 
861 aa  512  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88659e-07 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  34.92 
 
 
861 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  34.81 
 
 
858 aa  499  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  30.54 
 
 
851 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  30.31 
 
 
851 aa  401  1e-110  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  25.74 
 
 
847 aa  289  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.3 
 
 
844 aa  261  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  37.78 
 
 
861 aa  259  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  25.92 
 
 
863 aa  246  1e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25.92 
 
 
863 aa  245  2e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  31.62 
 
 
569 aa  241  3e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  34.72 
 
 
851 aa  238  4e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  36.62 
 
 
395 aa  233  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  25.67 
 
 
813 aa  225  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  24.75 
 
 
854 aa  223  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  24.5 
 
 
871 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  24.82 
 
 
871 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  25.43 
 
 
880 aa  213  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  34.16 
 
 
556 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.57 
 
 
872 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  34.16 
 
 
556 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  35.78 
 
 
556 aa  212  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  25.8 
 
 
880 aa  209  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  24.38 
 
 
850 aa  207  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  33.54 
 
 
590 aa  206  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  28.31 
 
 
880 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  32.69 
 
 
568 aa  204  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  33.13 
 
 
867 aa  203  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  25.77 
 
 
880 aa  203  1e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  34.62 
 
 
850 aa  202  2e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.74946e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  34.62 
 
 
850 aa  202  2e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  32.21 
 
 
864 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.15 
 
 
880 aa  201  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  33.79 
 
 
855 aa  199  1e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  32.52 
 
 
844 aa  200  1e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  33.22 
 
 
867 aa  199  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  26.75 
 
 
879 aa  199  2e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  34.29 
 
 
850 aa  199  2e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  35.97 
 
 
850 aa  197  8e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  35.97 
 
 
850 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  35.97 
 
 
850 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  33 
 
 
881 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  35.61 
 
 
850 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  31.9 
 
 
844 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  23.06 
 
 
854 aa  194  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  34.3 
 
 
866 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  33.91 
 
 
870 aa  187  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  31.1 
 
 
872 aa  186  1e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  36.52 
 
 
881 aa  186  2e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  36.18 
 
 
881 aa  186  2e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  30 
 
 
896 aa  184  5e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  33.45 
 
 
429 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  32.23 
 
 
346 aa  181  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  29.36 
 
 
862 aa  180  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  32.44 
 
 
877 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  33.22 
 
 
869 aa  179  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  33.57 
 
 
875 aa  179  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  34.13 
 
 
880 aa  177  1e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  34.13 
 
 
880 aa  175  3e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  33.79 
 
 
880 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  32.75 
 
 
877 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  32.75 
 
 
877 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  32.17 
 
 
883 aa  172  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  35.66 
 
 
876 aa  164  4e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  31.32 
 
 
864 aa  164  8e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  32.51 
 
 
864 aa  163  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  31.07 
 
 
864 aa  163  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  31.8 
 
 
850 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  28.82 
 
 
861 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  26.25 
 
 
875 aa  161  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  32.74 
 
 
889 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  32.74 
 
 
889 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  32.74 
 
 
889 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  32.51 
 
 
864 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  28.25 
 
 
557 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  32.16 
 
 
864 aa  158  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  31.67 
 
 
864 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  22.27 
 
 
739 aa  133  1e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  28.71 
 
 
322 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  28.18 
 
 
307 aa  119  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.61457e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  24.61 
 
 
1132 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  26.35 
 
 
1118 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  20.67 
 
 
723 aa  94.7  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  20.47 
 
 
839 aa  92.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  22.71 
 
 
592 aa  91.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  22.67 
 
 
852 aa  89.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  22.31 
 
 
578 aa  88.6  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  21.94 
 
 
1098 aa  83.2  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  24.93 
 
 
1113 aa  82.4  3e-14  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>