134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1564 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  98.99 
 
 
395 aa  805    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  100 
 
 
569 aa  1139    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  36.94 
 
 
851 aa  335  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  36.94 
 
 
851 aa  334  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  35.46 
 
 
859 aa  333  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  35.27 
 
 
859 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  34.9 
 
 
861 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  34.9 
 
 
861 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  34.9 
 
 
861 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  34.9 
 
 
861 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  34.9 
 
 
861 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  34.9 
 
 
861 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  34.71 
 
 
861 aa  326  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  34.9 
 
 
861 aa  326  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  34.29 
 
 
858 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1846  hypothetical protein  98.73 
 
 
159 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000154391  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  31.54 
 
 
844 aa  265  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  31.19 
 
 
861 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  31.33 
 
 
881 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  29.91 
 
 
870 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  33.53 
 
 
851 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  32.04 
 
 
847 aa  254  3e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  29.35 
 
 
871 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  30.31 
 
 
854 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  29.53 
 
 
871 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.29 
 
 
872 aa  250  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  28.54 
 
 
864 aa  246  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  29.14 
 
 
880 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  29.04 
 
 
880 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  32.23 
 
 
813 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  29.91 
 
 
863 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  31.62 
 
 
840 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  29.12 
 
 
872 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  29.19 
 
 
880 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.35 
 
 
863 aa  243  9e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  29.74 
 
 
880 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  29.94 
 
 
840 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  29.74 
 
 
880 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  29.94 
 
 
840 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  27.67 
 
 
855 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  28.9 
 
 
869 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.43 
 
 
875 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  28.27 
 
 
880 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  43.24 
 
 
590 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  28.79 
 
 
864 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  28.08 
 
 
880 aa  233  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  29.38 
 
 
880 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  29.14 
 
 
879 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  28.43 
 
 
844 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  27.98 
 
 
883 aa  230  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  29.5 
 
 
876 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  27.8 
 
 
877 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.24 
 
 
844 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  28.91 
 
 
556 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  28.91 
 
 
556 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  27.64 
 
 
850 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  29.5 
 
 
881 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  28.78 
 
 
881 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  28.33 
 
 
854 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  29.76 
 
 
867 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  26.98 
 
 
877 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  26.98 
 
 
877 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  29.01 
 
 
867 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  25.69 
 
 
557 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  28.44 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  26.77 
 
 
864 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  26.49 
 
 
850 aa  211  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  25.69 
 
 
864 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  27.1 
 
 
864 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  26.47 
 
 
889 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  26.47 
 
 
889 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  26.47 
 
 
889 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  32.35 
 
 
866 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  33.99 
 
 
346 aa  196  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  26.47 
 
 
864 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  28.02 
 
 
850 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  28.02 
 
 
850 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  28.02 
 
 
850 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  27.82 
 
 
850 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  26.29 
 
 
864 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  33.76 
 
 
429 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  31.6 
 
 
896 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  28.09 
 
 
850 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  28.27 
 
 
850 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  28.09 
 
 
850 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  32.05 
 
 
568 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  27.2 
 
 
875 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  27.01 
 
 
862 aa  173  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  26.49 
 
 
861 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  26.82 
 
 
739 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 
1132 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  23.03 
 
 
1118 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 
1094 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  22.77 
 
 
839 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  24.32 
 
 
346 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  21.62 
 
 
656 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  23.98 
 
 
592 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  21.51 
 
 
643 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  24.84 
 
 
905 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  22.98 
 
 
723 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>