232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4396 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  95.14 
 
 		 864 aa  1543    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  100 
 
 		 864 aa  1703    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  77.57 
 
 		 850 aa  1223    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  76.27 
 
 		 864 aa  1218    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  95.37 
 
 		 889 aa  1547    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  74.31 
 
 		 864 aa  1263    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  98.96 
 
 		 864 aa  1691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  95.37 
 
 		 889 aa  1547    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  91.67 
 
 		 864 aa  1531    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  95.37 
 
 		 889 aa  1547    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  44.22 
 
 		 883 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  42.59 
 
 		 877 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  42.59 
 
 		 877 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  41.64 
 
 		 875 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  42.47 
 
 		 866 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  39.12 
 
 		 869 aa  551  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  36.45 
 
 		 870 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  37.75 
 
 		 867 aa  515  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  37.25 
 
 		 867 aa  512  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  37.45 
 
 		 880 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  37.63 
 
 		 880 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  37.98 
 
 		 880 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  37.58 
 
 		 880 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  37.61 
 
 		 880 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  37.61 
 
 		 880 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  36.67 
 
 		 879 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  34.83 
 
 		 871 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  34.72 
 
 		 871 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  34.87 
 
 		 872 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  32.51 
 
 		 881 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  34.59 
 
 		 880 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  34.47 
 
 		 880 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  35.14 
 
 		 872 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  39.35 
 
 		 881 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  39.11 
 
 		 881 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  33.29 
 
 		 877 aa  413  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  37.57 
 
 		 876 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  38.5 
 
 		 864 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  38.75 
 
 		 844 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  38.55 
 
 		 844 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  28.94 
 
 		 813 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  34.32 
 
 		 854 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  31.79 
 
 		 850 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  31.55 
 
 		 850 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  36.71 
 
 		 855 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  31.51 
 
 		 863 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  31.39 
 
 		 863 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  31.32 
 
 		 850 aa  376  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  34.09 
 
 		 854 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  31.39 
 
 		 850 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  33.72 
 
 		 896 aa  361  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  31.15 
 
 		 850 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  31.56 
 
 		 850 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  31 
 
 		 850 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  34.65 
 
 		 850 aa  345  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  37.15 
 
 		 739 aa  342  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  42.68 
 
 		 429 aa  264  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  33.59 
 
 		 557 aa  253  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  41.16 
 
 		 346 aa  248  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  26.12 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  25.58 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  25.58 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  25.58 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.58 
 
 		 861 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  25.38 
 
 		 861 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.12 
 
 		 859 aa  239  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.35 
 
 		 861 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.44 
 
 		 859 aa  237  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  25.03 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  25.18 
 
 		 851 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  25.84 
 
 		 858 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  24.79 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  27.1 
 
 		 569 aa  212  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  28.99 
 
 		 556 aa  197  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  29.01 
 
 		 556 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  29.01 
 
 		 556 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  36.62 
 
 		 568 aa  184  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 840 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 840 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  23.36 
 
 		 847 aa  174  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  28.64 
 
 		 395 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  33.94 
 
 		 584 aa  171  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  24.22 
 
 		 851 aa  169  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  32.51 
 
 		 840 aa  164  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 516 aa  157  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  25.34 
 
 		 875 aa  156  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  25.29 
 
 		 862 aa  154  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  25.16 
 
 		 692 aa  144  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  31.05 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  26.61 
 
 		 861 aa  142  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.22 
 
 		 844 aa  140  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  28.97 
 
 		 590 aa  126  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  24.86 
 
 		 861 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  33.45 
 
 		 393 aa  114  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  27.86 
 
 		 311 aa  112  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 1118 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  31.27 
 
 		 339 aa  107  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  29.08 
 
 		 314 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  28.37 
 
 		 362 aa  102  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  29.1 
 
 		 313 aa  100  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>