225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5266 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  100 
 
 
739 aa  1429    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  52.51 
 
 
872 aa  650    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  48.4 
 
 
877 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  38.56 
 
 
880 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  38.03 
 
 
872 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  38.56 
 
 
880 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  35.47 
 
 
881 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  37.78 
 
 
875 aa  363  8e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  37.31 
 
 
863 aa  362  2e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  36.61 
 
 
863 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  37.34 
 
 
883 aa  348  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  35.97 
 
 
880 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  40.93 
 
 
864 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  35.88 
 
 
870 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  37.27 
 
 
879 aa  347  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  39.44 
 
 
855 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  35.72 
 
 
880 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  37.83 
 
 
880 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  40.78 
 
 
844 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  37.16 
 
 
877 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  37.16 
 
 
877 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  35.47 
 
 
867 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  38.18 
 
 
880 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  38.18 
 
 
880 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  38.24 
 
 
880 aa  334  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  35.49 
 
 
864 aa  333  9e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  35.62 
 
 
869 aa  330  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  40.84 
 
 
844 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  36.84 
 
 
864 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  34.87 
 
 
889 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  36.31 
 
 
864 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  35.79 
 
 
889 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  35.79 
 
 
889 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  34.23 
 
 
867 aa  327  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  38.69 
 
 
866 aa  326  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  30.18 
 
 
813 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  37.35 
 
 
850 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  36.56 
 
 
864 aa  316  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  36.19 
 
 
864 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  36.04 
 
 
864 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  33.78 
 
 
871 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  33.48 
 
 
871 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  34.42 
 
 
854 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  32.25 
 
 
850 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  32.53 
 
 
850 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  32.39 
 
 
850 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  37.1 
 
 
881 aa  290  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  33.19 
 
 
850 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  32.86 
 
 
850 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  33 
 
 
850 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  32.62 
 
 
850 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  34.96 
 
 
854 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  36.45 
 
 
876 aa  276  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  36.33 
 
 
881 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  38.97 
 
 
584 aa  258  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  32.74 
 
 
896 aa  245  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  33.79 
 
 
850 aa  244  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  36.05 
 
 
516 aa  211  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  37.2 
 
 
557 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  38.91 
 
 
393 aa  197  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  32.21 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  38.57 
 
 
360 aa  180  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  35.83 
 
 
351 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  36.1 
 
 
351 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  36.42 
 
 
343 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  36.42 
 
 
343 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  36.77 
 
 
344 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  38.08 
 
 
368 aa  174  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  34.88 
 
 
344 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  36.82 
 
 
362 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  29.69 
 
 
692 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  26.7 
 
 
861 aa  172  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  37.11 
 
 
344 aa  172  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  38.13 
 
 
344 aa  171  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  36.42 
 
 
351 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.35 
 
 
859 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.35 
 
 
859 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  37.09 
 
 
356 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.76 
 
 
861 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  25.92 
 
 
861 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  26.27 
 
 
858 aa  165  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  37.37 
 
 
368 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.64 
 
 
861 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  25.64 
 
 
861 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  25.48 
 
 
861 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  25.6 
 
 
861 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  25.64 
 
 
861 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  36.57 
 
 
351 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  36.15 
 
 
339 aa  162  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  39.15 
 
 
368 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  23.17 
 
 
851 aa  160  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  36.59 
 
 
363 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  38.71 
 
 
353 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  23.03 
 
 
851 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  34.49 
 
 
364 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  35.22 
 
 
376 aa  156  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  36.04 
 
 
378 aa  156  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  37.1 
 
 
353 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  33.55 
 
 
320 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  29.86 
 
 
338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>