170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0886 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  87.21 
 
 		 344 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  78.78 
 
 		 344 aa  564  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  81.98 
 
 		 344 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  78.27 
 
 		 351 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  74.7 
 
 		 351 aa  504  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  73.85 
 
 		 351 aa  486  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  58.86 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  56.13 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  53.77 
 
 		 368 aa  345  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  53.89 
 
 		 364 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  51.53 
 
 		 353 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  53.46 
 
 		 368 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  51.07 
 
 		 353 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  53.31 
 
 		 363 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  47.04 
 
 		 378 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  36.5 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  37.42 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  37.15 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  37.62 
 
 		 356 aa  199  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  36.88 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  35.33 
 
 		 368 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  36.25 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  36.25 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  38.15 
 
 		 872 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  36.74 
 
 		 739 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  33.44 
 
 		 880 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  33.44 
 
 		 880 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  34.15 
 
 		 877 aa  157  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  32.82 
 
 		 872 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  32.92 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  30.94 
 
 		 875 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  31.23 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  31.1 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  31.41 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  30.95 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  30.95 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  33.22 
 
 		 869 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  28.62 
 
 		 320 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  30.6 
 
 		 313 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  30.1 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  30.18 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  30.33 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  31.38 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  29.76 
 
 		 338 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  31.42 
 
 		 355 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  30.09 
 
 		 692 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  30.95 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  28.34 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  30.72 
 
 		 870 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  30.1 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  28.52 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  26.38 
 
 		 850 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  30.65 
 
 		 340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  29.97 
 
 		 867 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  29.75 
 
 		 867 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  34.36 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  26.07 
 
 		 850 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0683  integral membrane protein-like protein  28.88 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.636144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  26.78 
 
 		 850 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  32.28 
 
 		 864 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  29.11 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  33.86 
 
 		 844 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  29.1 
 
 		 881 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  33.33 
 
 		 844 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  26.06 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  31.13 
 
 		 866 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  26.76 
 
 		 850 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  26.42 
 
 		 850 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1342  hypothetical protein  28.93 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  27.9 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  26.42 
 
 		 850 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  26.76 
 
 		 850 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  28.57 
 
 		 871 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  32.91 
 
 		 896 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  28.57 
 
 		 871 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3039  hypothetical protein  28.27 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0362949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  30.45 
 
 		 863 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  27.49 
 
 		 517 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  30.45 
 
 		 863 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  29.49 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  29.5 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  29.5 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  28.42 
 
 		 854 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  29.81 
 
 		 879 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  29.29 
 
 		 880 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  28.37 
 
 		 516 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  33.92 
 
 		 850 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  30.07 
 
 		 880 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  26.44 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  33.59 
 
 		 855 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  29.67 
 
 		 880 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  28 
 
 		 864 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  26.48 
 
 		 317 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  29.37 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  26.45 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  25.52 
 
 		 813 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  28.62 
 
 		 864 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  27.11 
 
 		 880 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>