236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1396 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  80.21 
 
 
880 aa  1277    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  96.48 
 
 
880 aa  1624    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  100 
 
 
880 aa  1749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  80.09 
 
 
880 aa  1276    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  63.97 
 
 
876 aa  934    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  80.34 
 
 
879 aa  1346    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  80.33 
 
 
880 aa  1299    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  76.91 
 
 
881 aa  1123    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  76.2 
 
 
881 aa  1130    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  78.75 
 
 
880 aa  1337    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  37.44 
 
 
870 aa  567  1e-160  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  39.01 
 
 
869 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  40.8 
 
 
883 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  41.67 
 
 
877 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  38.01 
 
 
867 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  41.67 
 
 
877 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  42.12 
 
 
866 aa  538  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  37.34 
 
 
881 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  37.95 
 
 
867 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  37.86 
 
 
875 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  37.95 
 
 
872 aa  515  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  38.72 
 
 
864 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  35.59 
 
 
871 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  35.59 
 
 
871 aa  499  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  37.21 
 
 
880 aa  491  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  36.98 
 
 
880 aa  492  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  37.11 
 
 
864 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  36.7 
 
 
872 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  39.33 
 
 
850 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  36.54 
 
 
889 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  36.54 
 
 
889 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  36.54 
 
 
889 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  40.72 
 
 
855 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  37.83 
 
 
864 aa  479  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  37.2 
 
 
864 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  40.69 
 
 
844 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  40.32 
 
 
864 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  37.35 
 
 
864 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  37.11 
 
 
864 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  40.69 
 
 
844 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  36.3 
 
 
877 aa  462  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  33.62 
 
 
813 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  35.08 
 
 
863 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  35.19 
 
 
863 aa  442  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  35.25 
 
 
854 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  37.89 
 
 
854 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  32.99 
 
 
850 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  32.99 
 
 
850 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  34.19 
 
 
850 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  34.31 
 
 
850 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  32.75 
 
 
850 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  34.54 
 
 
850 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  34.77 
 
 
850 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  36.24 
 
 
739 aa  376  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  33.61 
 
 
850 aa  341  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  33.21 
 
 
896 aa  331  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  38.27 
 
 
557 aa  331  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  43.2 
 
 
429 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  27.7 
 
 
861 aa  258  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.84 
 
 
861 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  27.59 
 
 
861 aa  253  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  28.13 
 
 
851 aa  252  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  28.28 
 
 
851 aa  252  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  27.59 
 
 
861 aa  250  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.58 
 
 
859 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  27.48 
 
 
861 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  27.48 
 
 
861 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.47 
 
 
859 aa  248  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  27.36 
 
 
861 aa  248  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.36 
 
 
861 aa  248  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  30.85 
 
 
858 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  29.04 
 
 
569 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  40.56 
 
 
346 aa  231  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  33.14 
 
 
556 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  33.14 
 
 
556 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  31.16 
 
 
556 aa  224  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  27.64 
 
 
840 aa  217  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  27.43 
 
 
851 aa  213  9e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  27.25 
 
 
840 aa  213  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  27.25 
 
 
840 aa  213  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  32.35 
 
 
395 aa  194  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  23.23 
 
 
861 aa  194  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  31.61 
 
 
584 aa  191  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  37.89 
 
 
568 aa  190  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.52 
 
 
844 aa  184  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  27.05 
 
 
847 aa  179  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  27.93 
 
 
862 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  31.09 
 
 
516 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  26.53 
 
 
875 aa  162  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  26.56 
 
 
692 aa  160  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  29.94 
 
 
590 aa  156  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  30.06 
 
 
517 aa  149  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  25.16 
 
 
861 aa  147  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  30.77 
 
 
312 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  30.7 
 
 
314 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  30.62 
 
 
351 aa  126  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  30.49 
 
 
362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  31.66 
 
 
393 aa  120  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  30.97 
 
 
368 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  32.79 
 
 
356 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>