229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1597 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1708    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  54.51 
 
 
872 aa  867    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  48.55 
 
 
739 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  35.75 
 
 
881 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  42.71 
 
 
855 aa  506  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  36.92 
 
 
870 aa  499  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  35.71 
 
 
872 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  41.93 
 
 
864 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  35.87 
 
 
880 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  39.04 
 
 
877 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  39.04 
 
 
877 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  35.87 
 
 
880 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  41.68 
 
 
844 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  37.16 
 
 
867 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  36.54 
 
 
867 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  41.42 
 
 
844 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  39.52 
 
 
883 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  37.35 
 
 
869 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  39.93 
 
 
866 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  35.11 
 
 
863 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  36.46 
 
 
854 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  36.5 
 
 
880 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  34.88 
 
 
863 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  37.62 
 
 
880 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  36.62 
 
 
880 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  34.61 
 
 
850 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  36.46 
 
 
875 aa  452  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  37.76 
 
 
880 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  37.76 
 
 
880 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  37.29 
 
 
880 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  33.93 
 
 
850 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  34.05 
 
 
850 aa  446  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  36.6 
 
 
854 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  36.83 
 
 
871 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  36.83 
 
 
871 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  36.87 
 
 
879 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  34.84 
 
 
864 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  31.25 
 
 
813 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  33.61 
 
 
850 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  34.01 
 
 
864 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  34.57 
 
 
850 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  33.57 
 
 
864 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  33.37 
 
 
850 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  33.02 
 
 
850 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  36.2 
 
 
850 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  34.79 
 
 
864 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  38.03 
 
 
881 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  33.77 
 
 
889 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  33.77 
 
 
889 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  33.77 
 
 
889 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  38.89 
 
 
881 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  36.91 
 
 
876 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  33.65 
 
 
864 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  33.41 
 
 
864 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  35.52 
 
 
850 aa  361  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  35.33 
 
 
896 aa  355  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  39.04 
 
 
557 aa  347  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28 
 
 
859 aa  244  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  39.54 
 
 
429 aa  244  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.91 
 
 
859 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  27.14 
 
 
861 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.87 
 
 
861 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  27.75 
 
 
861 aa  241  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  40.88 
 
 
346 aa  241  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  27.85 
 
 
858 aa  239  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  27.94 
 
 
861 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  27.94 
 
 
861 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  27.86 
 
 
861 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.94 
 
 
861 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  27.94 
 
 
861 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  26.54 
 
 
851 aa  226  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  27.8 
 
 
569 aa  224  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  26.57 
 
 
851 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.55 
 
 
851 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  35.42 
 
 
584 aa  211  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  28.74 
 
 
556 aa  205  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  27.05 
 
 
844 aa  203  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  29.53 
 
 
556 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  29.53 
 
 
556 aa  202  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  33.14 
 
 
516 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  25.66 
 
 
840 aa  189  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  25.66 
 
 
840 aa  189  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  24.94 
 
 
847 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  33.14 
 
 
568 aa  180  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  36.2 
 
 
590 aa  180  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  32.44 
 
 
840 aa  179  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  32.29 
 
 
861 aa  178  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  24.37 
 
 
875 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  35.91 
 
 
393 aa  168  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  31.8 
 
 
395 aa  167  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  37.25 
 
 
360 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  35.74 
 
 
339 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  28.77 
 
 
517 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  34.59 
 
 
351 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  33.95 
 
 
344 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  33.02 
 
 
344 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  36.11 
 
 
368 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  36.01 
 
 
356 aa  155  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  26.35 
 
 
861 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  33.66 
 
 
368 aa  154  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>