140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1522 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  100 
 
 
861 aa  1752    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  33.81 
 
 
847 aa  499  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  32.75 
 
 
851 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  31.21 
 
 
844 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  31.1 
 
 
851 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  31.21 
 
 
851 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  32.53 
 
 
861 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  31.58 
 
 
861 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.26 
 
 
859 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.26 
 
 
859 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.69 
 
 
861 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  31.46 
 
 
861 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  31.58 
 
 
861 aa  426  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  31.58 
 
 
861 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  31.46 
 
 
861 aa  425  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  31.58 
 
 
861 aa  426  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  32.49 
 
 
858 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  28.92 
 
 
840 aa  353  7e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  28.92 
 
 
840 aa  353  7e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  28.85 
 
 
840 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  39.08 
 
 
590 aa  271  4e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  32.72 
 
 
569 aa  271  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  28.31 
 
 
813 aa  245  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.18 
 
 
872 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  36.45 
 
 
395 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  25.24 
 
 
867 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  24.65 
 
 
863 aa  227  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  24.68 
 
 
863 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  25.79 
 
 
881 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  26.6 
 
 
850 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  26.46 
 
 
850 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  27.55 
 
 
854 aa  221  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  25.33 
 
 
870 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  26.66 
 
 
850 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  27.97 
 
 
883 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  27.97 
 
 
877 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  27.97 
 
 
877 aa  214  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  27.42 
 
 
871 aa  211  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  27.17 
 
 
871 aa  208  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  25.21 
 
 
850 aa  204  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  26.46 
 
 
850 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  27.05 
 
 
877 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  25.96 
 
 
855 aa  198  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  26.21 
 
 
850 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  26.08 
 
 
850 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  25.95 
 
 
850 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  25.24 
 
 
896 aa  195  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  26.99 
 
 
854 aa  194  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  33.96 
 
 
867 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  25.88 
 
 
556 aa  190  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  26.78 
 
 
557 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  24.39 
 
 
879 aa  189  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  32.39 
 
 
866 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  30.82 
 
 
556 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  30.82 
 
 
556 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  33.43 
 
 
844 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  34.64 
 
 
346 aa  185  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  33.13 
 
 
864 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  23.28 
 
 
880 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  33.89 
 
 
869 aa  183  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  23.02 
 
 
880 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  32.83 
 
 
844 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  33.01 
 
 
875 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  23.95 
 
 
880 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  24.68 
 
 
864 aa  180  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  23.07 
 
 
880 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  24.07 
 
 
875 aa  174  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  22.85 
 
 
880 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  30.64 
 
 
429 aa  171  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  32.06 
 
 
880 aa  170  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  32.06 
 
 
880 aa  169  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  22.5 
 
 
880 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  25 
 
 
862 aa  163  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  30.19 
 
 
872 aa  161  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  25.08 
 
 
850 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  29.13 
 
 
861 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  29.77 
 
 
881 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  27.73 
 
 
568 aa  155  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  29.77 
 
 
881 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  27.74 
 
 
864 aa  146  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  27.22 
 
 
864 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  26.91 
 
 
889 aa  141  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  26.91 
 
 
889 aa  141  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  26.91 
 
 
889 aa  141  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  26.61 
 
 
864 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  29.32 
 
 
864 aa  140  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  26.3 
 
 
864 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  30.16 
 
 
876 aa  136  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  23.65 
 
 
723 aa  110  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  22.15 
 
 
739 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  23.49 
 
 
592 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 
1094 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  23.98 
 
 
917 aa  105  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  29.31 
 
 
322 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  26.22 
 
 
1098 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  23.08 
 
 
852 aa  96.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  27.18 
 
 
307 aa  95.1  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  25 
 
 
1172 aa  94  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  24.15 
 
 
1100 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  23.14 
 
 
656 aa  92  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>