61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1457 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  88.52 
 
 		 307 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  58.33 
 
 		 851 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  57.67 
 
 		 851 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  32.18 
 
 		 840 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  32.18 
 
 		 840 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  29.21 
 
 		 847 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  30.65 
 
 		 861 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.27 
 
 		 859 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.44 
 
 		 861 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  29.44 
 
 		 861 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  29.44 
 
 		 861 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.44 
 
 		 861 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  29.44 
 
 		 861 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  29.44 
 
 		 861 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  29.44 
 
 		 861 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.52 
 
 		 859 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  29.05 
 
 		 861 aa  99.4  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  29.67 
 
 		 858 aa  99.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  31.15 
 
 		 840 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.27 
 
 		 851 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  24.03 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  23.66 
 
 		 850 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  23.25 
 
 		 850 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.67 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  22.59 
 
 		 850 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  23.77 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.35 
 
 		 813 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  22.81 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  23.93 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  21.43 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  22.78 
 
 		 863 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  22.53 
 
 		 875 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  22.78 
 
 		 863 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  30.88 
 
 		 783 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  30.58 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  30.58 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  25.35 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  25.53 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  21.48 
 
 		 870 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  26.53 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  23.73 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  25.9 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  21.2 
 
 		 850 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  21.9 
 
 		 392 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  25.53 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  25.53 
 
 		 378 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  24.6 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  26.45 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  22.22 
 
 		 739 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  20.85 
 
 		 850 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  21.35 
 
 		 850 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  20.85 
 
 		 850 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  30.21 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  35.8 
 
 		 880 aa  43.9  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  27.55 
 
 		 362 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  22.86 
 
 		 881 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.16 
 
 		 877 aa  43.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  28.57 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  28.74 
 
 		 322 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>