48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2377 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  663    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  32.83 
 
 
339 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  29.47 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  29.97 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  25.46 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  29.26 
 
 
329 aa  56.2  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  34.57 
 
 
1195 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1913  hypothetical protein  28.97 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  37.93 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  25.83 
 
 
345 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  24.15 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  25.47 
 
 
345 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  24.56 
 
 
346 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  34.21 
 
 
329 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1430  hypothetical protein  28.31 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12769  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4804  hypothetical protein  28.92 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0479679  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  31.76 
 
 
351 aa  47  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  33.33 
 
 
370 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4553  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
356 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  28.42 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  38.67 
 
 
801 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  36.05 
 
 
843 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  36.96 
 
 
773 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  34.94 
 
 
859 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  37.97 
 
 
793 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  34.94 
 
 
859 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  25.28 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  32.48 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  33.02 
 
 
783 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  24.38 
 
 
392 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  33.73 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  33.73 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  33.73 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  33.73 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  33.73 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  25.28 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  33.73 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1180  hypothetical protein  41.38 
 
 
305 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00445325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  33.73 
 
 
861 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  28.7 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1993  hypothetical protein  35.05 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795631  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  32.53 
 
 
861 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  28.67 
 
 
353 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1099  hypothetical protein  29.13 
 
 
349 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  31.07 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  31.71 
 
 
339 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  28.57 
 
 
322 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  30 
 
 
341 aa  43.1  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>