173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2915 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  92.98 
 
 
351 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  71.35 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  65.09 
 
 
368 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  60.92 
 
 
356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  47.66 
 
 
393 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  45.43 
 
 
339 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  37.58 
 
 
360 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  37.7 
 
 
344 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  36.25 
 
 
351 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  34.8 
 
 
344 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  35.64 
 
 
353 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  35.64 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  36.72 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  33.04 
 
 
364 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  33.44 
 
 
363 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  33.03 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  33.75 
 
 
368 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  35.59 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  33.12 
 
 
368 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  36.42 
 
 
739 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  32.9 
 
 
351 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  32.89 
 
 
351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  36.45 
 
 
872 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  36.98 
 
 
378 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  35.14 
 
 
850 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  34.8 
 
 
850 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  33.11 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  34.12 
 
 
850 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  33.11 
 
 
350 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  31.86 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  32.02 
 
 
880 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  32.02 
 
 
880 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  32.19 
 
 
350 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  32.88 
 
 
350 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  29.62 
 
 
338 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  33 
 
 
877 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  34.14 
 
 
850 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  33.79 
 
 
850 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  33.79 
 
 
850 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  33.45 
 
 
850 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  33.11 
 
 
872 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  30.03 
 
 
881 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  30.09 
 
 
692 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  33.55 
 
 
320 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  33.55 
 
 
320 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  31.03 
 
 
355 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  31.05 
 
 
875 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  32.87 
 
 
516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  32.94 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  31.33 
 
 
584 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  34.71 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  30.59 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  32.89 
 
 
311 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  29.7 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  30.79 
 
 
870 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  29.7 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  32.4 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  31.72 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  32.35 
 
 
869 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  32.36 
 
 
317 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  30.18 
 
 
313 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  30.82 
 
 
867 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  30.51 
 
 
867 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  32.86 
 
 
866 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  30.37 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  29.33 
 
 
517 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  31.29 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  30.26 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  30.26 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  32.17 
 
 
883 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  27.89 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  27.33 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  29.38 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  29.76 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3039  hypothetical protein  31.82 
 
 
344 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0362949  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  28.62 
 
 
871 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  28.62 
 
 
871 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  32.27 
 
 
864 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  32.16 
 
 
844 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  27.52 
 
 
316 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  29.78 
 
 
326 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0683  integral membrane protein-like protein  30.09 
 
 
324 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.636144 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  30.52 
 
 
877 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  30.52 
 
 
877 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  32.55 
 
 
844 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  32.92 
 
 
896 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  29.08 
 
 
880 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  28.9 
 
 
880 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  28.52 
 
 
880 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  27.91 
 
 
319 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  31.99 
 
 
879 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  29.09 
 
 
318 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1342  hypothetical protein  29.63 
 
 
338 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  26.71 
 
 
880 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  28.9 
 
 
313 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  28.25 
 
 
880 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  28.25 
 
 
880 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>