51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1259 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  603  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  88.52 
 
 		 322 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  58.31 
 
 		 851 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  57.63 
 
 		 851 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  31.95 
 
 		 840 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  31.95 
 
 		 840 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  28.03 
 
 		 847 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  29.15 
 
 		 861 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  26.83 
 
 		 859 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  27.02 
 
 		 861 aa  99  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.02 
 
 		 861 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  27.02 
 
 		 861 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.02 
 
 		 861 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  27.02 
 
 		 861 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  27.02 
 
 		 861 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  27.02 
 
 		 861 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.24 
 
 		 859 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  30.04 
 
 		 840 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  27.18 
 
 		 861 aa  94  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.67 
 
 		 851 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  28.24 
 
 		 858 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.9 
 
 		 844 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  21.96 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  23.77 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  25.85 
 
 		 813 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  19.34 
 
 		 850 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  21.18 
 
 		 850 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  20.08 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  25.21 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  19.69 
 
 		 850 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  24.73 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  22.43 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  21.83 
 
 		 863 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  21.83 
 
 		 863 aa  46.2  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  22.86 
 
 		 392 aa  46.2  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  25.23 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  26.36 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  29.81 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  28.04 
 
 		 866 aa  43.9  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  27.37 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 368 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  27.94 
 
 		 783 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  34.57 
 
 		 880 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  21.13 
 
 		 875 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  27.88 
 
 		 345 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  29.59 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  29.59 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.19 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  20 
 
 		 317 aa  42.7  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  25.49 
 
 		 378 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>