45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3061 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  673    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  93.33 
 
 
345 aa  631  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  38.63 
 
 
348 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  30.32 
 
 
346 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  28.97 
 
 
247 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  28.57 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  27.44 
 
 
1195 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  35.46 
 
 
783 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  32.74 
 
 
916 aa  59.7  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  31.86 
 
 
859 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  24.62 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  21.26 
 
 
392 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  34.31 
 
 
313 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  32.43 
 
 
853 aa  55.8  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  34.04 
 
 
341 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  31.36 
 
 
362 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  32.81 
 
 
773 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  41.82 
 
 
811 aa  50.4  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3454  hypothetical protein  33.04 
 
 
873 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0261651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  25.29 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  32.17 
 
 
843 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2970  hypothetical protein  27.14 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.145955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  25.45 
 
 
801 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  25.21 
 
 
385 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  32.43 
 
 
793 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  27.72 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  33.53 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1099  hypothetical protein  19.37 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  29.1 
 
 
367 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  27.56 
 
 
302 aa  46.6  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0731  hypothetical protein  24 
 
 
573 aa  46.6  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  31.25 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  49.06 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  18.67 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  27.07 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  31.53 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  27.07 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  27.07 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  30.21 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1259  hypothetical protein  34.25 
 
 
307 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000161457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  43.64 
 
 
872 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  31.58 
 
 
339 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  32.32 
 
 
326 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  24.45 
 
 
348 aa  42.7  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>