28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0158 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  99.73 
 
 
378 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  99.73 
 
 
378 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  749    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  79.55 
 
 
392 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  78.57 
 
 
367 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  72.45 
 
 
427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  52.38 
 
 
392 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  49.24 
 
 
396 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  35.38 
 
 
773 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  34.75 
 
 
793 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  33.33 
 
 
843 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  24.91 
 
 
346 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  22.19 
 
 
347 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  32.31 
 
 
783 aa  50.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  31.39 
 
 
801 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  33.56 
 
 
344 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  35 
 
 
851 aa  48.9  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  30.91 
 
 
859 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  33.08 
 
 
329 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  35.79 
 
 
792 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  35.38 
 
 
374 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  27.07 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  25.53 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  26.83 
 
 
858 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  25 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  29.47 
 
 
847 aa  44.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  26.83 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  24.36 
 
 
350 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>