233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2712 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  98.82 
 
 		 850 aa  1692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  77.76 
 
 		 850 aa  1318    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  77.41 
 
 		 850 aa  1313    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  77.76 
 
 		 850 aa  1323    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 850 aa  1709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  98.71 
 
 		 850 aa  1693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  97.53 
 
 		 850 aa  1557    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  35.61 
 
 		 881 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  38.05 
 
 		 864 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  38.42 
 
 		 844 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  38.17 
 
 		 844 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  35.18 
 
 		 872 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  33.45 
 
 		 855 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  32.25 
 
 		 870 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  33.06 
 
 		 854 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  33.73 
 
 		 877 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  33.57 
 
 		 813 aa  452  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  30.33 
 
 		 867 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  34.24 
 
 		 854 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  30.87 
 
 		 875 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  32.94 
 
 		 863 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  32.51 
 
 		 869 aa  446  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  32.7 
 
 		 863 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  34.31 
 
 		 880 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  30.9 
 
 		 867 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  32.93 
 
 		 866 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  33.95 
 
 		 880 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  32.46 
 
 		 877 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  32.46 
 
 		 877 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  31.83 
 
 		 883 aa  428  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  31.23 
 
 		 880 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  31.47 
 
 		 872 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  31.35 
 
 		 880 aa  429  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  31.25 
 
 		 871 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  32.91 
 
 		 879 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  31.13 
 
 		 871 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 880 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  34.42 
 
 		 880 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  31.81 
 
 		 864 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  31.88 
 
 		 864 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  34.23 
 
 		 880 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  34.77 
 
 		 881 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  34.23 
 
 		 880 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  31.35 
 
 		 864 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  34.59 
 
 		 881 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  32.09 
 
 		 889 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  31.97 
 
 		 889 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  31.97 
 
 		 889 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  30.5 
 
 		 850 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  30.89 
 
 		 864 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  31.11 
 
 		 864 aa  389  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  31.19 
 
 		 864 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  32.96 
 
 		 876 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  29.31 
 
 		 850 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  32.57 
 
 		 739 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  30 
 
 		 896 aa  344  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  35.25 
 
 		 557 aa  324  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  29.58 
 
 		 851 aa  300  9e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  29.34 
 
 		 851 aa  296  9e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.26 
 
 		 859 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.95 
 
 		 861 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  27.95 
 
 		 861 aa  290  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  28.13 
 
 		 861 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  27.95 
 
 		 861 aa  290  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.69 
 
 		 859 aa  287  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  27.84 
 
 		 861 aa  286  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  27.84 
 
 		 861 aa  286  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  27.84 
 
 		 861 aa  286  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  27.84 
 
 		 861 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  27.63 
 
 		 858 aa  277  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  37.89 
 
 		 429 aa  245  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  38.49 
 
 		 346 aa  233  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  27.03 
 
 		 861 aa  228  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.78 
 
 		 851 aa  227  8e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  27.13 
 
 		 847 aa  225  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  29.89 
 
 		 556 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  27.04 
 
 		 840 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  28.34 
 
 		 569 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  30.98 
 
 		 556 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  30.98 
 
 		 556 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  29.77 
 
 		 516 aa  206  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  36.84 
 
 		 840 aa  203  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  36.84 
 
 		 840 aa  203  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  30.17 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  28.49 
 
 		 584 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  36.24 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  31.32 
 
 		 395 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.44 
 
 		 844 aa  183  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  35.22 
 
 		 356 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  36.81 
 
 		 368 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  26.75 
 
 		 517 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  36.19 
 
 		 311 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  33.79 
 
 		 351 aa  164  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  25.04 
 
 		 692 aa  159  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  24.92 
 
 		 862 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  33.79 
 
 		 343 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  33.79 
 
 		 343 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  33.88 
 
 		 362 aa  157  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  35.71 
 
 		 320 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  35.71 
 
 		 320 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>