233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0644 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  100 
 
 
850 aa  1645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  81.82 
 
 
896 aa  1254    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  80.12 
 
 
346 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  32.55 
 
 
881 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  37.44 
 
 
883 aa  425  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  36.92 
 
 
866 aa  424  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  36.16 
 
 
877 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  36.16 
 
 
877 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  37.26 
 
 
872 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  39.4 
 
 
855 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  38.97 
 
 
864 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  35.01 
 
 
854 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  33.07 
 
 
880 aa  392  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  34.68 
 
 
863 aa  386  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  34.56 
 
 
864 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  32.95 
 
 
880 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  30.64 
 
 
850 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  33.56 
 
 
867 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  30.33 
 
 
850 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  36.11 
 
 
864 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  34.68 
 
 
863 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  35.87 
 
 
877 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  33.1 
 
 
867 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  30.33 
 
 
850 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  32.76 
 
 
872 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  33.68 
 
 
870 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  35.49 
 
 
864 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  33.92 
 
 
869 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  32.89 
 
 
871 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  35.06 
 
 
850 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  32.77 
 
 
871 aa  363  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  33.6 
 
 
880 aa  360  8e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  33.72 
 
 
880 aa  360  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  35.13 
 
 
889 aa  360  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  35.13 
 
 
889 aa  360  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  35.19 
 
 
854 aa  359  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  35.13 
 
 
889 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  34.62 
 
 
880 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  34.79 
 
 
864 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  34.3 
 
 
875 aa  356  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  27.54 
 
 
813 aa  355  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  32.95 
 
 
879 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  34.17 
 
 
864 aa  351  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  34.05 
 
 
864 aa  349  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  34.25 
 
 
880 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  34.76 
 
 
880 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  34.65 
 
 
880 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  36.32 
 
 
881 aa  320  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  35.44 
 
 
881 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  46.28 
 
 
844 aa  311  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  46.28 
 
 
844 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  29.25 
 
 
861 aa  301  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  29.22 
 
 
861 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  29.22 
 
 
861 aa  301  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.22 
 
 
861 aa  301  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  29.22 
 
 
861 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  29.22 
 
 
861 aa  300  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29 
 
 
861 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  29.08 
 
 
859 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  28.89 
 
 
859 aa  296  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  29 
 
 
861 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  36.67 
 
 
557 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  34.53 
 
 
876 aa  287  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  33.79 
 
 
739 aa  277  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  29.09 
 
 
858 aa  275  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  37.19 
 
 
850 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  36.99 
 
 
850 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  36.91 
 
 
850 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  32.9 
 
 
850 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  37.21 
 
 
568 aa  233  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  37.84 
 
 
429 aa  231  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  25.32 
 
 
840 aa  226  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  25.32 
 
 
840 aa  226  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  24.66 
 
 
851 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  24.16 
 
 
851 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  24.34 
 
 
861 aa  222  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  38.02 
 
 
556 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  26.32 
 
 
844 aa  211  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  36.42 
 
 
556 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  36.42 
 
 
556 aa  211  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  26.3 
 
 
569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  31.02 
 
 
395 aa  195  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  29.15 
 
 
840 aa  188  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  33.22 
 
 
847 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  28.38 
 
 
692 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  32.65 
 
 
317 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  32.65 
 
 
317 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  24.34 
 
 
851 aa  162  3e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  30.64 
 
 
590 aa  159  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  36.39 
 
 
313 aa  156  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  36.36 
 
 
317 aa  155  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  34.22 
 
 
311 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  32.56 
 
 
312 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  31.17 
 
 
314 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  31.77 
 
 
320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  31.77 
 
 
320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  32.91 
 
 
516 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  33.63 
 
 
393 aa  140  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  31.44 
 
 
584 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  34.26 
 
 
320 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>