121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1066 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  100 
 
 
590 aa  1173    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  37.5 
 
 
847 aa  362  1e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  36.99 
 
 
851 aa  344  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  34.5 
 
 
844 aa  290  6e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  30.94 
 
 
851 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  30.76 
 
 
851 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  37.75 
 
 
861 aa  274  3e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  30.73 
 
 
859 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  30.73 
 
 
859 aa  243  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  38.37 
 
 
858 aa  243  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  38.11 
 
 
861 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  30.03 
 
 
861 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  30.03 
 
 
861 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  30.03 
 
 
861 aa  239  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  30.03 
 
 
861 aa  239  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  30.03 
 
 
861 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  30.03 
 
 
861 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  30.03 
 
 
861 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  36.79 
 
 
569 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  37.33 
 
 
395 aa  232  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  34.8 
 
 
813 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  32.47 
 
 
840 aa  212  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  29.16 
 
 
863 aa  212  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  32.07 
 
 
854 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  32.29 
 
 
854 aa  206  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  33.65 
 
 
840 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  33.65 
 
 
840 aa  204  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  28.52 
 
 
863 aa  204  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  37.17 
 
 
556 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  37.17 
 
 
556 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  34.34 
 
 
850 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  34.04 
 
 
850 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  34.04 
 
 
850 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  34.04 
 
 
850 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  28.84 
 
 
880 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  35.64 
 
 
556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  36.59 
 
 
850 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  36.59 
 
 
850 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  36.59 
 
 
850 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  32.82 
 
 
875 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  31.45 
 
 
881 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  28.84 
 
 
880 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  33.72 
 
 
864 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  36.46 
 
 
877 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  34.36 
 
 
872 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  28.14 
 
 
872 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  34.02 
 
 
855 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  34.14 
 
 
844 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  33.84 
 
 
844 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  32.52 
 
 
869 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  32.99 
 
 
867 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  30.33 
 
 
867 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  33.44 
 
 
877 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  33.44 
 
 
877 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  33.23 
 
 
883 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  31.73 
 
 
866 aa  166  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  29.94 
 
 
870 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  32.62 
 
 
871 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  32.62 
 
 
871 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  31.18 
 
 
862 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  30.32 
 
 
850 aa  160  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  29.2 
 
 
880 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  29.34 
 
 
896 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  29.2 
 
 
880 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  30.51 
 
 
568 aa  157  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  31.43 
 
 
346 aa  157  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  32.25 
 
 
429 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  31.33 
 
 
881 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  32.45 
 
 
861 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  31.51 
 
 
876 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  32.35 
 
 
881 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  30.56 
 
 
880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  30.79 
 
 
880 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  30.74 
 
 
880 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  30.56 
 
 
880 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  29.9 
 
 
879 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  29.54 
 
 
557 aa  146  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  28.22 
 
 
850 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  31.03 
 
 
864 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  27.65 
 
 
875 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  29.49 
 
 
864 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  31.64 
 
 
864 aa  131  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  28.3 
 
 
864 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  26.6 
 
 
889 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  26.6 
 
 
889 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  26.6 
 
 
889 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  29.15 
 
 
864 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  29.15 
 
 
864 aa  124  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  23.65 
 
 
723 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  24.38 
 
 
839 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  24.62 
 
 
578 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  21.08 
 
 
592 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  23.55 
 
 
850 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  25.94 
 
 
905 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  25.62 
 
 
852 aa  87.8  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  23.19 
 
 
1132 aa  87  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  31.98 
 
 
739 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5267  hypothetical protein  39.45 
 
 
108 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  22.12 
 
 
857 aa  84  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  21.71 
 
 
1120 aa  80.1  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>