132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1037 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  100 
 
 		 852 aa  1759    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  46.3 
 
 		 857 aa  727    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  31.81 
 
 		 839 aa  355  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  38.76 
 
 		 905 aa  311  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  28.68 
 
 		 877 aa  292  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  28.32 
 
 		 844 aa  278  4e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  32.22 
 
 		 850 aa  276  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  35.15 
 
 		 723 aa  253  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  38.3 
 
 		 346 aa  249  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  26.46 
 
 		 556 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  26.22 
 
 		 556 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  26.22 
 
 		 556 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  23.51 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 1101 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  22.41 
 
 		 1172 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.32 
 
 		 859 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.32 
 
 		 859 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  22.13 
 
 		 1100 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  23.72 
 
 		 861 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  23.72 
 
 		 861 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  23.72 
 
 		 861 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.72 
 
 		 861 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.72 
 
 		 861 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  23.72 
 
 		 861 aa  118  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  23.42 
 
 		 861 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  23.42 
 
 		 861 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  25.62 
 
 		 847 aa  114  9e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 1112 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  22.01 
 
 		 1112 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  21.79 
 
 		 1111 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  26.18 
 
 		 1118 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  25.35 
 
 		 862 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  21.93 
 
 		 1113 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  21.49 
 
 		 858 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  22.49 
 
 		 861 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  24.43 
 
 		 1132 aa  108  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  21.2 
 
 		 1098 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.46 
 
 		 844 aa  107  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  25.55 
 
 		 863 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  24.15 
 
 		 851 aa  102  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25.91 
 
 		 863 aa  102  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  24.92 
 
 		 867 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  23.98 
 
 		 875 aa  101  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  24.92 
 
 		 867 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  23.84 
 
 		 850 aa  97.8  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  23.05 
 
 		 851 aa  97.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  21.28 
 
 		 1094 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  24.04 
 
 		 861 aa  96.7  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  21.39 
 
 		 578 aa  96.3  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  22.83 
 
 		 880 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  20.12 
 
 		 592 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  22.74 
 
 		 851 aa  94.7  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  22.03 
 
 		 599 aa  94.7  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  22.53 
 
 		 879 aa  92.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  23.73 
 
 		 869 aa  92  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  24.85 
 
 		 896 aa  92  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  25.82 
 
 		 854 aa  90.9  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  23.15 
 
 		 866 aa  90.5  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  21.5 
 
 		 877 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  21.41 
 
 		 1138 aa  89.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  21.5 
 
 		 877 aa  89.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  23.25 
 
 		 840 aa  89  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  19.61 
 
 		 1100 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  22.54 
 
 		 880 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  22.54 
 
 		 880 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  21.65 
 
 		 597 aa  87.4  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  23.05 
 
 		 883 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  21.97 
 
 		 872 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  22.98 
 
 		 871 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  25.62 
 
 		 590 aa  86.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  22.98 
 
 		 871 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  23.15 
 
 		 880 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  22.84 
 
 		 880 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  22.61 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  22.84 
 
 		 870 aa  85.1  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2225  hypothetical protein  24.84 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  23.06 
 
 		 875 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  23.96 
 
 		 880 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  24.45 
 
 		 876 aa  82  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  23.99 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  23.28 
 
 		 854 aa  81.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  23.39 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  23.84 
 
 		 881 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  21.36 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  24.31 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  21.36 
 
 		 840 aa  80.1  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  22.29 
 
 		 346 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  23.75 
 
 		 864 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  19.43 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  21.72 
 
 		 864 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  17.11 
 
 		 1120 aa  77.8  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  23.26 
 
 		 850 aa  77.8  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  24.23 
 
 		 881 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  20.36 
 
 		 917 aa  75.5  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  20.9 
 
 		 1147 aa  74.7  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  23.15 
 
 		 881 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  22.96 
 
 		 864 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  20.69 
 
 		 569 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  19.54 
 
 		 850 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  22.3 
 
 		 872 aa  73.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>