134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3190 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  42.76 
 
 
861 aa  724    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  100 
 
 
875 aa  1757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  47.65 
 
 
862 aa  778    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  33.85 
 
 
556 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  33.85 
 
 
556 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  31.56 
 
 
556 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  25.18 
 
 
861 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  28 
 
 
813 aa  196  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  26.65 
 
 
858 aa  196  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  27.33 
 
 
568 aa  195  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.4 
 
 
859 aa  195  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  25.44 
 
 
870 aa  195  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.74 
 
 
861 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  24.59 
 
 
861 aa  193  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  24.59 
 
 
861 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  24.45 
 
 
861 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  24.45 
 
 
861 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  24.59 
 
 
861 aa  192  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.45 
 
 
861 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.52 
 
 
859 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  26.42 
 
 
880 aa  184  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  28.12 
 
 
881 aa  184  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  25.45 
 
 
877 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  26.11 
 
 
880 aa  182  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  25.45 
 
 
877 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.33 
 
 
883 aa  179  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  25.39 
 
 
872 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  25.16 
 
 
867 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.84 
 
 
869 aa  174  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  25.04 
 
 
872 aa  168  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  24.56 
 
 
863 aa  167  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  27.2 
 
 
569 aa  167  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  25.67 
 
 
864 aa  167  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  25 
 
 
867 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  27.44 
 
 
864 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  24.37 
 
 
877 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  24.47 
 
 
851 aa  164  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  25.59 
 
 
850 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  25.62 
 
 
864 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  24.02 
 
 
851 aa  163  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  24.41 
 
 
863 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  24.16 
 
 
875 aa  160  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  26.91 
 
 
844 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  26.25 
 
 
840 aa  160  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  26.91 
 
 
844 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.14 
 
 
851 aa  157  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  24.69 
 
 
861 aa  156  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  24.95 
 
 
855 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1421  hypothetical protein  26.97 
 
 
840 aa  154  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0726685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1449  hypothetical protein  26.97 
 
 
840 aa  154  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00038982  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  25.28 
 
 
871 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  25.35 
 
 
879 aa  151  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  23.96 
 
 
866 aa  151  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  25.28 
 
 
871 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  25.65 
 
 
880 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  26.52 
 
 
880 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.52 
 
 
880 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  25.05 
 
 
880 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  23.94 
 
 
864 aa  144  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  22.77 
 
 
854 aa  144  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  25.23 
 
 
880 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  24.96 
 
 
889 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  24.96 
 
 
889 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  24.96 
 
 
889 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  24.52 
 
 
850 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  24.32 
 
 
850 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  23.51 
 
 
864 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 
1132 aa  141  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  24.67 
 
 
880 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  28.85 
 
 
847 aa  140  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  25.1 
 
 
876 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  24.76 
 
 
850 aa  140  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  23.45 
 
 
557 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  28.24 
 
 
395 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  25.5 
 
 
864 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  27.65 
 
 
590 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  28.06 
 
 
850 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  28.33 
 
 
850 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  25.34 
 
 
864 aa  134  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  28.06 
 
 
850 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  25.05 
 
 
850 aa  130  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  24.1 
 
 
854 aa  130  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  25.19 
 
 
881 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  25.38 
 
 
881 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  25.95 
 
 
429 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  29.07 
 
 
844 aa  125  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  26.12 
 
 
896 aa  118  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  27.78 
 
 
346 aa  117  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  24.85 
 
 
739 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  22.39 
 
 
592 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  23.31 
 
 
1118 aa  108  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  22.58 
 
 
656 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  23.8 
 
 
905 aa  102  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  23.98 
 
 
852 aa  101  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  21.29 
 
 
701 aa  98.6  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  21.47 
 
 
857 aa  98.2  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  22.13 
 
 
643 aa  92  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  20.23 
 
 
839 aa  91.3  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  22.77 
 
 
938 aa  90.9  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  21.23 
 
 
723 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>