123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1547 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  76.64 
 
 
643 aa  789    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  100 
 
 
656 aa  1281    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  46.4 
 
 
701 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  52.36 
 
 
599 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  48.63 
 
 
1098 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
1113 aa  369  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  39.66 
 
 
592 aa  355  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
1100 aa  354  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  42.77 
 
 
578 aa  340  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 
1094 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
1111 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
1172 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
1112 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 
1112 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
1100 aa  325  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
1101 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 
1120 aa  306  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 
1138 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  37.39 
 
 
1147 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  30.71 
 
 
917 aa  233  7.000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
1132 aa  230  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
1118 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  36.49 
 
 
597 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  27.18 
 
 
556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25.4 
 
 
556 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25.4 
 
 
556 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  26.95 
 
 
568 aa  146  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  31.52 
 
 
938 aa  146  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  22.58 
 
 
875 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  20.28 
 
 
569 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  29.9 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  30.06 
 
 
839 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  23.37 
 
 
862 aa  119  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  21.99 
 
 
861 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  23.53 
 
 
861 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.81 
 
 
859 aa  108  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.08 
 
 
861 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  21.63 
 
 
861 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  26.71 
 
 
872 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.77 
 
 
859 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  21.63 
 
 
861 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.63 
 
 
861 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  21.45 
 
 
861 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  21.73 
 
 
861 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  21.45 
 
 
861 aa  105  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25.43 
 
 
863 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  25.17 
 
 
863 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  27.76 
 
 
857 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  23.16 
 
 
395 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  21.39 
 
 
858 aa  101  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  19.49 
 
 
851 aa  98.6  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  19.13 
 
 
851 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.15 
 
 
880 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.31 
 
 
880 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  24.82 
 
 
870 aa  96.3  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  23.97 
 
 
877 aa  95.1  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  23.97 
 
 
877 aa  95.1  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  20.3 
 
 
813 aa  94.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  26.88 
 
 
854 aa  94.4  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  26.39 
 
 
850 aa  93.6  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  22.92 
 
 
861 aa  90.9  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  26.61 
 
 
854 aa  90.9  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  24.5 
 
 
905 aa  90.5  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  23.84 
 
 
872 aa  87.8  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  23.88 
 
 
864 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  24.36 
 
 
889 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  24.36 
 
 
889 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  24.36 
 
 
889 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  24.59 
 
 
864 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  25.61 
 
 
850 aa  84  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  27.59 
 
 
739 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  23.99 
 
 
847 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  22.53 
 
 
852 aa  82  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.56 
 
 
851 aa  81.6  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  24.46 
 
 
864 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  24.96 
 
 
864 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  22.9 
 
 
883 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  25.13 
 
 
879 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  28.49 
 
 
864 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  24.85 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  25.23 
 
 
867 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  26.32 
 
 
877 aa  79.7  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  25.32 
 
 
875 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  25.07 
 
 
723 aa  77.4  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  28.07 
 
 
844 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.4 
 
 
844 aa  76.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  24.59 
 
 
557 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  27.89 
 
 
844 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  25.31 
 
 
880 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  23.21 
 
 
881 aa  73.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  25.65 
 
 
896 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  24.29 
 
 
864 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  25.4 
 
 
850 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  24.21 
 
 
866 aa  72.4  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  24.11 
 
 
864 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  24.91 
 
 
880 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.41 
 
 
869 aa  70.1  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  20.93 
 
 
840 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  24.6 
 
 
880 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  24.56 
 
 
880 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>