124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2745 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1273    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  76.64 
 
 		 656 aa  800    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  45.66 
 
 		 701 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  51.67 
 
 		 599 aa  491  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  46.11 
 
 		 1098 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  38.69 
 
 		 592 aa  356  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 1113 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 1100 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  41.54 
 
 		 578 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 1094 aa  341  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 1111 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 1112 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 1112 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 1172 aa  324  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 		 1101 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 1100 aa  318  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 		 1138 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 1120 aa  298  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  37.39 
 
 		 1147 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 1132 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  28.05 
 
 		 917 aa  229  1e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 1118 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  27.36 
 
 		 556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  31.83 
 
 		 597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  26.27 
 
 		 556 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  26.27 
 
 		 556 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  30.38 
 
 		 938 aa  145  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  26.45 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  29.06 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  21.47 
 
 		 875 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  20.85 
 
 		 569 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  22.41 
 
 		 862 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  28.47 
 
 		 880 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  23.83 
 
 		 861 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  28.18 
 
 		 839 aa  114  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  27.41 
 
 		 880 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  24.74 
 
 		 861 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.92 
 
 		 859 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.52 
 
 		 861 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  22.35 
 
 		 861 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  28.28 
 
 		 879 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  21.72 
 
 		 859 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  24.24 
 
 		 863 aa  107  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  20.47 
 
 		 851 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  20.83 
 
 		 858 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  23.94 
 
 		 863 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  22.02 
 
 		 861 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  22.02 
 
 		 861 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  22.18 
 
 		 861 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  21.32 
 
 		 813 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.02 
 
 		 861 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  27.35 
 
 		 872 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  24.23 
 
 		 861 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  25.83 
 
 		 870 aa  105  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  19.83 
 
 		 851 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  21.91 
 
 		 395 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  27.58 
 
 		 880 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  27.09 
 
 		 880 aa  96.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  27.09 
 
 		 880 aa  96.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.61 
 
 		 851 aa  94.7  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  26.09 
 
 		 854 aa  94.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  24.66 
 
 		 864 aa  94  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  27.79 
 
 		 880 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  27.09 
 
 		 877 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  27.09 
 
 		 877 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  27.79 
 
 		 880 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  27.62 
 
 		 880 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  24.49 
 
 		 854 aa  91.3  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  25.17 
 
 		 850 aa  90.9  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  25.39 
 
 		 867 aa  89.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  26.2 
 
 		 850 aa  88.6  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  27.38 
 
 		 881 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  29.07 
 
 		 739 aa  88.2  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  24.53 
 
 		 864 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  26.12 
 
 		 875 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  23 
 
 		 723 aa  84.3  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  24.24 
 
 		 861 aa  84  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  25.57 
 
 		 883 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  27.15 
 
 		 876 aa  82.4  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  28.21 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.43 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  24.7 
 
 		 867 aa  81.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  24.31 
 
 		 864 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  23.32 
 
 		 905 aa  80.5  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  27.38 
 
 		 881 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.81 
 
 		 872 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  24.78 
 
 		 864 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  19.43 
 
 		 852 aa  79.7  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  27.77 
 
 		 844 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  23.73 
 
 		 889 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  23.73 
 
 		 889 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  23.73 
 
 		 889 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.11 
 
 		 844 aa  77.4  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  22.78 
 
 		 871 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  23 
 
 		 871 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  22.37 
 
 		 847 aa  74.7  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  25.63 
 
 		 869 aa  73.9  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  22.18 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  23.99 
 
 		 850 aa  71.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  24.91 
 
 		 896 aa  71.6  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>