176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0161 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  100 
 
 		 584 aa  1163    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  56.56 
 
 		 516 aa  529  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  49.4 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  38.97 
 
 		 739 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  35.83 
 
 		 872 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  35.43 
 
 		 877 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  29.64 
 
 		 881 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  36.19 
 
 		 864 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  36.25 
 
 		 844 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  30.02 
 
 		 863 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  30.07 
 
 		 870 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.86 
 
 		 863 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  28.36 
 
 		 813 aa  200  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  36.11 
 
 		 844 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  30.16 
 
 		 880 aa  196  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  30.16 
 
 		 880 aa  196  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  31.33 
 
 		 880 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  30.75 
 
 		 872 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  36.7 
 
 		 855 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  32.76 
 
 		 864 aa  193  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  31.66 
 
 		 880 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  37.55 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  28.95 
 
 		 854 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  28.17 
 
 		 692 aa  188  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  30.28 
 
 		 850 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  29.98 
 
 		 850 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  33.14 
 
 		 864 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  34.05 
 
 		 880 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  32.75 
 
 		 864 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  29.78 
 
 		 850 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  31.19 
 
 		 875 aa  182  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  31.72 
 
 		 850 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  30.83 
 
 		 867 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  32.58 
 
 		 877 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  32.58 
 
 		 877 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  31.88 
 
 		 879 aa  180  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  33.81 
 
 		 889 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  32.11 
 
 		 864 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  33.81 
 
 		 889 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  33.81 
 
 		 889 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  30.46 
 
 		 867 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  33.14 
 
 		 880 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  32.61 
 
 		 880 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  32.61 
 
 		 880 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  31.85 
 
 		 869 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  32.85 
 
 		 866 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  33.44 
 
 		 312 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  31.2 
 
 		 883 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  34.95 
 
 		 317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  34.95 
 
 		 317 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  35.84 
 
 		 320 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  35.84 
 
 		 320 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  30.84 
 
 		 854 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  33.46 
 
 		 864 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  33.73 
 
 		 864 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  32.97 
 
 		 314 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  28.86 
 
 		 850 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  28.95 
 
 		 850 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  28.88 
 
 		 850 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  32.29 
 
 		 871 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  32.01 
 
 		 871 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  32.18 
 
 		 876 aa  153  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  31.78 
 
 		 313 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  31.23 
 
 		 393 aa  150  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  30.17 
 
 		 368 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  30.96 
 
 		 339 aa  147  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  30.03 
 
 		 320 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  30.89 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  30.8 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  33 
 
 		 317 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  28.96 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  31.33 
 
 		 343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  32.33 
 
 		 351 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  31.33 
 
 		 343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  29.76 
 
 		 317 aa  133  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  31.35 
 
 		 362 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  31.54 
 
 		 881 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  30.97 
 
 		 360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  30.43 
 
 		 332 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  30.8 
 
 		 850 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  29.39 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  30.13 
 
 		 319 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  30.2 
 
 		 340 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  26.52 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  29.89 
 
 		 896 aa  123  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  30.54 
 
 		 332 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  32.5 
 
 		 881 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  28.66 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  28.71 
 
 		 318 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  27.81 
 
 		 344 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  29.73 
 
 		 310 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  30.08 
 
 		 316 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  30.62 
 
 		 338 aa  117  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  29.64 
 
 		 353 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  28.01 
 
 		 344 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  30.29 
 
 		 353 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  28.28 
 
 		 318 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  27.61 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  27.61 
 
 		 318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>