173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0267 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  100 
 
 
692 aa  1356    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  28 
 
 
854 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  28.02 
 
 
584 aa  183  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  29.69 
 
 
739 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  26.78 
 
 
863 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  26.86 
 
 
863 aa  178  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  24.8 
 
 
881 aa  177  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  26.68 
 
 
875 aa  177  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  23.94 
 
 
870 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  26.05 
 
 
850 aa  170  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  27.3 
 
 
869 aa  170  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  25.89 
 
 
850 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  25.58 
 
 
850 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  30.37 
 
 
864 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  26.47 
 
 
867 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  30.33 
 
 
516 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  30.61 
 
 
844 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  35.29 
 
 
320 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  35.29 
 
 
320 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  27.49 
 
 
867 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  33.96 
 
 
311 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  32.04 
 
 
356 aa  156  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.02 
 
 
872 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  30.92 
 
 
312 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  34.6 
 
 
350 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  34.11 
 
 
350 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  31.18 
 
 
368 aa  154  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  30.65 
 
 
844 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.93 
 
 
880 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  25.86 
 
 
880 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  31.79 
 
 
314 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  29.6 
 
 
351 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  34.84 
 
 
315 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  30.93 
 
 
344 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  34.32 
 
 
340 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  30.48 
 
 
344 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  25.04 
 
 
864 aa  147  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  27.31 
 
 
880 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  30.09 
 
 
343 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  27.43 
 
 
517 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  30.09 
 
 
343 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  27.27 
 
 
854 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  29.79 
 
 
351 aa  144  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  30.99 
 
 
362 aa  144  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  32.58 
 
 
313 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  30.84 
 
 
344 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  24.96 
 
 
880 aa  143  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  24.63 
 
 
880 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  30.79 
 
 
317 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  30.79 
 
 
317 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  31.75 
 
 
360 aa  140  8.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  25.26 
 
 
872 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  32.89 
 
 
317 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  33.67 
 
 
350 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  26.26 
 
 
871 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  33.91 
 
 
331 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  33.56 
 
 
350 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  33.56 
 
 
350 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  30.52 
 
 
344 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  26.26 
 
 
871 aa  137  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  29.9 
 
 
368 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  30.72 
 
 
351 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  24.88 
 
 
864 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  33.21 
 
 
316 aa  135  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  31.68 
 
 
338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  29.68 
 
 
363 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0683  integral membrane protein-like protein  30.66 
 
 
324 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.636144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  22.29 
 
 
813 aa  134  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  32.65 
 
 
355 aa  133  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  27.98 
 
 
850 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  29.32 
 
 
855 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  31.47 
 
 
323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  31.47 
 
 
323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  30.25 
 
 
339 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  27.13 
 
 
880 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  27.45 
 
 
880 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  29.79 
 
 
317 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  32.4 
 
 
315 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  28.92 
 
 
376 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  27.13 
 
 
880 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  26.78 
 
 
883 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  30 
 
 
353 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  29.58 
 
 
364 aa  130  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  28.75 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  28.57 
 
 
368 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  28.71 
 
 
351 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  24.8 
 
 
889 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  24.8 
 
 
889 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  24.64 
 
 
889 aa  129  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  26.52 
 
 
879 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  29.68 
 
 
353 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  30.29 
 
 
310 aa  127  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  27.42 
 
 
866 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  25.45 
 
 
864 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  26.28 
 
 
877 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  26.28 
 
 
877 aa  126  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  32.64 
 
 
313 aa  124  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3039  hypothetical protein  33.12 
 
 
344 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0362949  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  32.54 
 
 
317 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  35.1 
 
 
319 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.412337 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>