167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0743 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  94.86 
 
 
350 aa  653    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  94.57 
 
 
350 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  69.36 
 
 
355 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  75 
 
 
350 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  71.93 
 
 
350 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  64.81 
 
 
340 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3039  hypothetical protein  58.5 
 
 
344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0362949  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  55.18 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  55.18 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  57.05 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  56.52 
 
 
331 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  57.96 
 
 
315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  53.85 
 
 
316 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0683  integral membrane protein-like protein  52.04 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.636144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  53.02 
 
 
310 aa  282  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  48.73 
 
 
317 aa  275  9e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  31.89 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  31.86 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  31.86 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  31.32 
 
 
351 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  30.94 
 
 
351 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  31.42 
 
 
356 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  30.72 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  31.17 
 
 
344 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  30.63 
 
 
364 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  31.53 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  30.74 
 
 
368 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  29.48 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  29.52 
 
 
351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  29.63 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  30.28 
 
 
368 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  31.56 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  32.31 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  33.67 
 
 
692 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  31.27 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  31.1 
 
 
360 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  30.68 
 
 
363 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  31.83 
 
 
317 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  29.27 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  37 
 
 
872 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  29.31 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  30.07 
 
 
850 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  29.73 
 
 
850 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  31.35 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  30.03 
 
 
338 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  31.08 
 
 
850 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  29.27 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  31.63 
 
 
850 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  31.97 
 
 
850 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  32.31 
 
 
850 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  29.49 
 
 
339 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  29.47 
 
 
317 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  29.05 
 
 
850 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  30.48 
 
 
881 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  33.9 
 
 
739 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  27.73 
 
 
314 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  29.61 
 
 
870 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  29.04 
 
 
378 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  26.82 
 
 
872 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  33.22 
 
 
332 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  29.64 
 
 
320 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  29.64 
 
 
320 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  31 
 
 
866 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  31.13 
 
 
517 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  28.62 
 
 
313 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  26.82 
 
 
880 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  28.96 
 
 
871 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  28.2 
 
 
875 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  28.96 
 
 
871 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  26.53 
 
 
880 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  27.27 
 
 
320 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  29.87 
 
 
584 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  29.11 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  31.01 
 
 
516 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  27.39 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  29.11 
 
 
317 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  29.57 
 
 
329 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  26.96 
 
 
867 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  27.07 
 
 
867 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  28.03 
 
 
877 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2286  integral membrane protein-like protein  30.59 
 
 
326 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.042451  hitchhiker  0.0000479445 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  31.94 
 
 
883 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  31.91 
 
 
877 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  31.91 
 
 
877 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3276  hypothetical protein  31.39 
 
 
332 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0014369  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  27.96 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  30.08 
 
 
318 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  27.67 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1342  hypothetical protein  27.91 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  28.02 
 
 
869 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  26 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  28.86 
 
 
863 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  28.86 
 
 
863 aa  84.3  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00755  conserved inner membrane protein  29.92 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0936  hypothetical protein  29.92 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  30.49 
 
 
896 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00772  hypothetical protein  29.92 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2854  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.552583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2855  hypothetical protein  29.92 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00195846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>