169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1326 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  99.69 
 
 
323 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  92.38 
 
 
315 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  63.09 
 
 
331 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  60.9 
 
 
310 aa  352  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  56.11 
 
 
350 aa  350  3e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  57.41 
 
 
350 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  58.36 
 
 
315 aa  348  9e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  53 
 
 
317 aa  340  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  57.65 
 
 
340 aa  338  9e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  55.18 
 
 
350 aa  338  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  54.27 
 
 
350 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  54.27 
 
 
350 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  57.61 
 
 
316 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  51.69 
 
 
355 aa  324  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0683  integral membrane protein-like protein  56.15 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.636144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3039  hypothetical protein  52.45 
 
 
344 aa  296  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0362949  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  31.4 
 
 
339 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  31.91 
 
 
344 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  31.34 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  30.74 
 
 
356 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  30.17 
 
 
344 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  29.64 
 
 
393 aa  138  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  30.54 
 
 
351 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  29.97 
 
 
368 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  32.39 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3203  hypothetical protein  31.8 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  29.69 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  30.07 
 
 
317 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  29.9 
 
 
362 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  29.77 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  29.7 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  29.7 
 
 
343 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  28.86 
 
 
351 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  29.11 
 
 
872 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  31.23 
 
 
360 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  31.47 
 
 
692 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  28.66 
 
 
317 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  32.76 
 
 
312 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  28.92 
 
 
364 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  32.65 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  28.87 
 
 
850 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  28.52 
 
 
850 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  30.29 
 
 
850 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  29.97 
 
 
850 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  28.18 
 
 
850 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  29.97 
 
 
850 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  29.97 
 
 
850 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  29.86 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  28.67 
 
 
881 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  29.86 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  28.47 
 
 
870 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  33.58 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  27.84 
 
 
739 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  29.17 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  26.6 
 
 
368 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  30.69 
 
 
338 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  29.09 
 
 
877 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  27.36 
 
 
317 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  27.36 
 
 
317 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  27.3 
 
 
320 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  28.09 
 
 
867 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  27.41 
 
 
376 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  27.08 
 
 
353 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  26.15 
 
 
363 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  28.62 
 
 
584 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  28.37 
 
 
869 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  28.09 
 
 
867 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  26.91 
 
 
880 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  26.91 
 
 
880 aa  104  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  27.06 
 
 
368 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  28.71 
 
 
871 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  26.46 
 
 
353 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  25.57 
 
 
313 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  27.88 
 
 
329 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3502  hypothetical protein  31.49 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  29.23 
 
 
871 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  27.76 
 
 
875 aa  99.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  28.67 
 
 
378 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  31.62 
 
 
896 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  28.18 
 
 
517 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  28.11 
 
 
813 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  28.06 
 
 
866 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.75 
 
 
872 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1342  hypothetical protein  27.8 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  28.52 
 
 
516 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5038  hypothetical protein  27.59 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00557373 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.6 
 
 
863 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  29.6 
 
 
863 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2647  hypothetical protein  28.18 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.412337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0811  hypothetical protein  29.64 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00494476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  29.27 
 
 
864 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.67 
 
 
844 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  28.37 
 
 
844 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  30 
 
 
854 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0012  hypothetical protein  26.57 
 
 
340 aa  85.9  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0011  hypothetical protein  30.39 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0846  inner membrane protein YbhN  25.91 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0959  inner membrane protein YbhN  27.92 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.262362  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0938  hypothetical protein  27.55 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>