168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1091 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1091  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  761    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1324  hypothetical protein  84.31 
 
 		 368 aa  625  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1469  hypothetical protein  79.46 
 
 		 368 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0291454  normal  0.344342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5547  hypothetical protein  77.22 
 
 		 364 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.327902 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4466  hypothetical protein  76.56 
 
 		 363 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3833  hypothetical protein  75.89 
 
 		 353 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00492954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1656  hypothetical protein  76.49 
 
 		 353 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0333336  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0756  hypothetical protein  54.23 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0184  hypothetical protein  57.23 
 
 		 360 aa  359  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5268  hypothetical protein  53.47 
 
 		 344 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4925  hypothetical protein  52.71 
 
 		 344 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0633  hypothetical protein  51.1 
 
 		 351 aa  341  9e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0774  hypothetical protein  55.7 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.551414  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0504  hypothetical protein  53.51 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0886  hypothetical protein  58.04 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5838  hypothetical protein  39.62 
 
 		 378 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0841  integral membrane protein-like protein  38.83 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.18385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3194  integral membrane protein-like protein  35.56 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00740284  decreased coverage  0.00804794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1658  hypothetical protein  32.69 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.648259  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1041  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2915  hypothetical protein  33.03 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2688  hypothetical protein  33.03 
 
 		 343 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2810  putative membrane protein of unknown function  33.03 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.48002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3589  hypothetical protein  31.94 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106529  hitchhiker  0.00246674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  33.65 
 
 		 872 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  35.22 
 
 		 739 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5004  hypothetical protein  32.28 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2169  integral membrane protein-like protein  32.22 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  31.97 
 
 		 877 aa  143  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3617  hypothetical protein  30.55 
 
 		 350 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  30.82 
 
 		 881 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  31.12 
 
 		 872 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0743  hypothetical protein  32.31 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 880 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  30.77 
 
 		 880 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3951  hypothetical protein  29.12 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0277158  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4027  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0781  hypothetical protein  31.66 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0598791  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0821  hypothetical protein  31.66 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.915427  normal  0.313105 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5128  hypothetical protein  30.89 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.79824  normal  0.0594862 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4044  hypothetical protein  32.13 
 
 		 313 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  29.79 
 
 		 850 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0267  hypothetical protein  28.92 
 
 		 692 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  27.65 
 
 		 850 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  27.3 
 
 		 850 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  29.7 
 
 		 850 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  29.45 
 
 		 850 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  27.3 
 
 		 850 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2527  hypothetical protein  33.46 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  30.27 
 
 		 850 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  29.05 
 
 		 863 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09860  membrane protein  31.68 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  29.18 
 
 		 863 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  30.16 
 
 		 844 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  30.16 
 
 		 864 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0484  hypothetical protein  29.5 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1145  hypothetical protein  28.96 
 
 		 312 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0832  hypothetical protein  27.9 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  28.75 
 
 		 870 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5576  hypothetical protein  27.62 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5424  hypothetical protein  30.49 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06897  hitchhiker  0.00740076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1342  hypothetical protein  32.62 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.481458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0879  hypothetical protein  27.67 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0683  integral membrane protein-like protein  31.52 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.636144 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  30.27 
 
 		 869 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3039  hypothetical protein  32.84 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0362949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  30.16 
 
 		 844 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  27.61 
 
 		 854 aa  110  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0901  hypothetical protein  27.61 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  29.77 
 
 		 867 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1286  hypothetical protein  27.41 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  30.16 
 
 		 867 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1326  hypothetical protein  27.41 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0756849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3384  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2485  hypothetical protein  30.16 
 
 		 310 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.607254  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1858  hypothetical protein  28.4 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0717922  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  31.15 
 
 		 896 aa  104  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0024  hypothetical protein  28.71 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  28.57 
 
 		 875 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  30.18 
 
 		 516 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  30.48 
 
 		 880 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  30.58 
 
 		 880 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  27.59 
 
 		 880 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1045  hypothetical protein  27.74 
 
 		 517 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000634893  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0804  hypothetical protein  27.53 
 
 		 313 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  32.38 
 
 		 850 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  29.02 
 
 		 866 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  29.43 
 
 		 879 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1006  protein of unknown function DUF470  30.52 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0977  hypothetical protein  30.52 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0161  integral membrane protein  26.3 
 
 		 584 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0150458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  31.05 
 
 		 855 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  27.47 
 
 		 880 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1503  hypothetical protein  29.53 
 
 		 317 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1476  hypothetical protein  29.53 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  28.83 
 
 		 880 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  28.04 
 
 		 871 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  28.04 
 
 		 871 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  28.83 
 
 		 880 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  28.75 
 
 		 877 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.628735 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>