44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1846 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1846  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  304  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000154391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  98.73 
 
 		 569 aa  301  3.0000000000000004e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  33.94 
 
 		 872 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5266  hypothetical protein  31.67 
 
 		 739 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  32.11 
 
 		 880 aa  70.9  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0585  hypothetical protein  32.11 
 
 		 880 aa  70.9  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.351317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  29.17 
 
 		 872 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  35.94 
 
 		 813 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  25.87 
 
 		 877 aa  63.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2435  hypothetical protein  30.43 
 
 		 881 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  normal  0.757251 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  33.61 
 
 		 851 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  33.61 
 
 		 851 aa  62  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4019  hypothetical protein  26.4 
 
 		 864 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  28.1 
 
 		 880 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  28.1 
 
 		 880 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  28.93 
 
 		 876 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  30.58 
 
 		 880 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  30.58 
 
 		 880 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  30.58 
 
 		 880 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  30.51 
 
 		 879 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  28.93 
 
 		 880 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.83 
 
 		 859 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.83 
 
 		 859 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  25.83 
 
 		 861 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  25.83 
 
 		 861 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  25.83 
 
 		 861 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  25.83 
 
 		 861 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.83 
 
 		 861 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  25.83 
 
 		 861 aa  51.2  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  25.83 
 
 		 861 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  25.83 
 
 		 861 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  25.89 
 
 		 844 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  27.43 
 
 		 875 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  27.03 
 
 		 858 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  23.24 
 
 		 870 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1685  hypothetical protein  25.86 
 
 		 516 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  26.09 
 
 		 871 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1522  hypothetical protein  29.87 
 
 		 861 aa  47.4  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  26.79 
 
 		 871 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1448  hypothetical protein  22.41 
 
 		 557 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0328641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  29.75 
 
 		 881 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  30.58 
 
 		 881 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  22.43 
 
 		 556 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  25.71 
 
 		 855 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>