More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0024 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0024  peptidase  100 
 
 		 381 aa  736    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.02023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  55.73 
 
 		 473 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  56.92 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  53.5 
 
 		 465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  52.74 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  57.28 
 
 		 374 aa  332  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  53.46 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  54.98 
 
 		 469 aa  325  9e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  55.62 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  51.58 
 
 		 476 aa  322  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  48.26 
 
 		 456 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  52.19 
 
 		 450 aa  302  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  50.45 
 
 		 446 aa  301  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  48.25 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  46.31 
 
 		 380 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  53.16 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  50 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  50 
 
 		 481 aa  296  6e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  46.65 
 
 		 478 aa  295  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  48.82 
 
 		 477 aa  293  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  48.49 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.04 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  45.75 
 
 		 450 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  47.06 
 
 		 450 aa  288  8e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  48 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  48 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  46.49 
 
 		 456 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  48 
 
 		 453 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  47.38 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.5 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  47.45 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  46.45 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  50.31 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  45.07 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  45.07 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  45.07 
 
 		 450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  48.81 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  46.63 
 
 		 450 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  47.38 
 
 		 451 aa  282  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.21 
 
 		 396 aa  282  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  46.63 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  46.91 
 
 		 450 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  49.84 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  44.79 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  47.83 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  44.15 
 
 		 455 aa  280  3e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  46.2 
 
 		 449 aa  279  6e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  44.65 
 
 		 386 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  46.53 
 
 		 403 aa  278  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.81 
 
 		 412 aa  278  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.22 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  43.6 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  44.24 
 
 		 474 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  44.34 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  44.24 
 
 		 474 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  47.74 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  45.54 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  43.6 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  43.6 
 
 		 455 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  47.38 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  43.6 
 
 		 455 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  43.73 
 
 		 402 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  43.73 
 
 		 386 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  45.24 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  48.09 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  43.6 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.06 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  47.77 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.06 
 
 		 401 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  44.69 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.77 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.06 
 
 		 401 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  46.06 
 
 		 401 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  49.53 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  46.3 
 
 		 455 aa  272  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  47.77 
 
 		 388 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  47.77 
 
 		 402 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  46.77 
 
 		 386 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  47.77 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.33 
 
 		 513 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  47.77 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  47.77 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  45.34 
 
 		 455 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  47.77 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  47.77 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  47.52 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  45.03 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  53.08 
 
 		 491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  46.82 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  47.2 
 
 		 468 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  42.9 
 
 		 460 aa  270  4e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  45.03 
 
 		 455 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  45.03 
 
 		 455 aa  269  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  45.03 
 
 		 455 aa  269  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  45.03 
 
 		 455 aa  269  5e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  45.03 
 
 		 455 aa  269  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  45.03 
 
 		 455 aa  269  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  45.03 
 
 		 455 aa  269  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  45.48 
 
 		 462 aa  270  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.96 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>