More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0747 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  81.91 
 
 		 705 aa  1182    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  51.78 
 
 		 708 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  95.3 
 
 		 702 aa  1370    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 702 aa  1423    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  43.49 
 
 		 698 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  34.42 
 
 		 751 aa  313  9e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 743 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 743 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 743 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  34.17 
 
 		 743 aa  308  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 743 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  34.22 
 
 		 743 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 719 aa  281  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 729 aa  277  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.09 
 
 		 710 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 710 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 706 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  30.13 
 
 		 712 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 707 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 707 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 707 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.39 
 
 		 738 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.84 
 
 		 724 aa  244  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 729 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  30.52 
 
 		 771 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 724 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 728 aa  238  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 715 aa  237  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.64 
 
 		 744 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 727 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 727 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 725 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 805 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.87 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.45 
 
 		 804 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 802 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  29.27 
 
 		 722 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 819 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.13 
 
 		 704 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 809 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 746 aa  212  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 772 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  28.7 
 
 		 772 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 823 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 722 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 729 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 685 aa  210  8e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 726 aa  210  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 773 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 729 aa  206  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 		 768 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 811 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 800 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 811 aa  203  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 761 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 729 aa  203  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 808 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 708 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 731 aa  201  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 777 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 730 aa  200  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 710 aa  200  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  26.38 
 
 		 801 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  29.29 
 
 		 758 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  26.03 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.27 
 
 		 737 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  27.39 
 
 		 753 aa  198  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 804 aa  198  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 		 716 aa  197  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 801 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  28.72 
 
 		 746 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 754 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 753 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 742 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 728 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 762 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 737 aa  191  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 750 aa  190  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  26.56 
 
 		 718 aa  189  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 724 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  26.03 
 
 		 728 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 707 aa  184  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  28.34 
 
 		 851 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 706 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 		 768 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 728 aa  182  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  26.44 
 
 		 763 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 		 839 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 749 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  26.48 
 
 		 720 aa  181  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 		 773 aa  179  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 770 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 761 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 755 aa  177  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  27.29 
 
 		 697 aa  177  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 710 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.65 
 
 		 714 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 742 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>